Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT3

Fam208b, Protein FAM208B, mousemouse

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Length 2,382 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam208bQ5DTT3 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fam208bQ5DTT3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fam208bQ5DTT3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fam208bQ5DTT3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fam208bQ5DTT3 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fam208bQ5DTT3 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fam208bQ5DTT3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fam208bQ5DTT3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fam208bQ5DTT3 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fam208bQ5DTT3 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fam208bQ5DTT3 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Fam208bQ5DTT3 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fam208bQ5DTT3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fam208bQ5DTT3 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fam208bQ5DTT3 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fam208bQ5DTT3 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Fam208bQ5DTT3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fam208bQ5DTT3 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fam208bQ5DTT3 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fam208bQ5DTT3 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fam208bQ5DTT3 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fam208bQ5DTT3 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fam208bQ5DTT3 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Fam208bQ5DTT3 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fam208bQ5DTT3 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fam208bQ5DTT3 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fam208bQ5DTT3 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fam208bQ5DTT3 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fam208bQ5DTT3 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fam208bQ5DTT3 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fam208bQ5DTT3 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fam208bQ5DTT3 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fam208bQ5DTT3 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fam208bQ5DTT3 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fam208bQ5DTT3 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Fam208bQ5DTT3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fam208bQ5DTT3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fam208bQ5DTT3 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fam208bQ5DTT3 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fam208bQ5DTT3 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Fam208bQ5DTT3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fam208bQ5DTT3 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fam208bQ5DTT3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fam208bQ5DTT3 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fam208bQ5DTT3 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fam208bQ5DTT3 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fam208bQ5DTT3 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fam208bQ5DTT3 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam208bQ5DTT3 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam208bQ5DTT3 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam208bQ5DTT3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam208bQ5DTT3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam208bQ5DTT3 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam208bQ5DTT3 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam208bQ5DTT3 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam208bQ5DTT3 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fam208bQ5DTT3 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fam208bQ5DTT3 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Fam208bQ5DTT3 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fam208bQ5DTT3 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fam208bQ5DTT3 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fam208bQ5DTT3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fam208bQ5DTT3 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fam208bQ5DTT3 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fam208bQ5DTT3 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fam208bQ5DTT3 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fam208bQ5DTT3 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Fam208bQ5DTT3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fam208bQ5DTT3 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Fam208bQ5DTT3 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fam208bQ5DTT3 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fam208bQ5DTT3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fam208bQ5DTT3 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fam208bQ5DTT3 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fam208bQ5DTT3 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fam208bQ5DTT3 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fam208bQ5DTT3 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fam208bQ5DTT3 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam208bQ5DTT3 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam208bQ5DTT3 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam208bQ5DTT3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam208bQ5DTT3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam208bQ5DTT3 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam208bQ5DTT3 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam208bQ5DTT3 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam208bQ5DTT3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam208bQ5DTT3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam208bQ5DTT3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam208bQ5DTT3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam208bQ5DTT3 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam208bQ5DTT3 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam208bQ5DTT3 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam208bQ5DTT3 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam208bQ5DTT3 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam208bQ5DTT3 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam208bQ5DTT3 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam208bQ5DTT3 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fam208bQ5DTT3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fam208bQ5DTT3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fam208bQ5DTT3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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