Protein–RNA interactions for Protein: Q5D525

Syce1l, Synaptonemal complex central element protein 1-like, mousemouse

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Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1lQ5D525 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Syce1lQ5D525 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Syce1lQ5D525 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Syce1lQ5D525 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Syce1lQ5D525 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Syce1lQ5D525 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Syce1lQ5D525 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Syce1lQ5D525 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Syce1lQ5D525 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Syce1lQ5D525 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Syce1lQ5D525 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Syce1lQ5D525 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Syce1lQ5D525 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Syce1lQ5D525 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Syce1lQ5D525 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Syce1lQ5D525 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Syce1lQ5D525 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Syce1lQ5D525 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Syce1lQ5D525 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Syce1lQ5D525 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Syce1lQ5D525 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Syce1lQ5D525 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Syce1lQ5D525 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Syce1lQ5D525 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Syce1lQ5D525 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Syce1lQ5D525 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Syce1lQ5D525 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Syce1lQ5D525 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Syce1lQ5D525 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Syce1lQ5D525 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Syce1lQ5D525 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Syce1lQ5D525 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Syce1lQ5D525 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Syce1lQ5D525 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Syce1lQ5D525 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Syce1lQ5D525 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Syce1lQ5D525 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Syce1lQ5D525 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Syce1lQ5D525 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Syce1lQ5D525 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Syce1lQ5D525 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Syce1lQ5D525 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Syce1lQ5D525 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Syce1lQ5D525 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Syce1lQ5D525 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Syce1lQ5D525 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Syce1lQ5D525 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Syce1lQ5D525 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Syce1lQ5D525 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Syce1lQ5D525 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Syce1lQ5D525 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Syce1lQ5D525 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Syce1lQ5D525 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Syce1lQ5D525 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Syce1lQ5D525 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Syce1lQ5D525 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Syce1lQ5D525 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Syce1lQ5D525 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Syce1lQ5D525 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Syce1lQ5D525 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Syce1lQ5D525 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Syce1lQ5D525 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Syce1lQ5D525 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Syce1lQ5D525 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Syce1lQ5D525 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Syce1lQ5D525 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Syce1lQ5D525 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Syce1lQ5D525 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Syce1lQ5D525 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Syce1lQ5D525 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Syce1lQ5D525 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Syce1lQ5D525 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Syce1lQ5D525 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Syce1lQ5D525 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Syce1lQ5D525 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Syce1lQ5D525 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Syce1lQ5D525 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Syce1lQ5D525 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Syce1lQ5D525 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Syce1lQ5D525 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Syce1lQ5D525 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Syce1lQ5D525 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Syce1lQ5D525 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Syce1lQ5D525 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Syce1lQ5D525 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Syce1lQ5D525 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Syce1lQ5D525 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Syce1lQ5D525 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Syce1lQ5D525 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Syce1lQ5D525 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Syce1lQ5D525 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Syce1lQ5D525 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Syce1lQ5D525 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Syce1lQ5D525 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Syce1lQ5D525 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Syce1lQ5D525 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Syce1lQ5D525 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Syce1lQ5D525 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Syce1lQ5D525 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Syce1lQ5D525 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
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