Protein–RNA interactions for Protein: Q3UXB0

Mbd3l2, Methyl-CpG-binding domain protein 3-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3l2Q3UXB0 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mbd3l2Q3UXB0 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mbd3l2Q3UXB0 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mbd3l2Q3UXB0 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Mbd3l2Q3UXB0 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mbd3l2Q3UXB0 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mbd3l2Q3UXB0 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mbd3l2Q3UXB0 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mbd3l2Q3UXB0 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mbd3l2Q3UXB0 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Mbd3l2Q3UXB0 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mbd3l2Q3UXB0 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Mbd3l2Q3UXB0 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mbd3l2Q3UXB0 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mbd3l2Q3UXB0 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mbd3l2Q3UXB0 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mbd3l2Q3UXB0 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mbd3l2Q3UXB0 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mbd3l2Q3UXB0 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mbd3l2Q3UXB0 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mbd3l2Q3UXB0 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mbd3l2Q3UXB0 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mbd3l2Q3UXB0 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mbd3l2Q3UXB0 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mbd3l2Q3UXB0 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mbd3l2Q3UXB0 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mbd3l2Q3UXB0 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mbd3l2Q3UXB0 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mbd3l2Q3UXB0 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mbd3l2Q3UXB0 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mbd3l2Q3UXB0 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mbd3l2Q3UXB0 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mbd3l2Q3UXB0 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mbd3l2Q3UXB0 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mbd3l2Q3UXB0 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mbd3l2Q3UXB0 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mbd3l2Q3UXB0 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mbd3l2Q3UXB0 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mbd3l2Q3UXB0 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mbd3l2Q3UXB0 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mbd3l2Q3UXB0 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mbd3l2Q3UXB0 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mbd3l2Q3UXB0 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mbd3l2Q3UXB0 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mbd3l2Q3UXB0 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mbd3l2Q3UXB0 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mbd3l2Q3UXB0 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mbd3l2Q3UXB0 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mbd3l2Q3UXB0 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mbd3l2Q3UXB0 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mbd3l2Q3UXB0 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mbd3l2Q3UXB0 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mbd3l2Q3UXB0 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mbd3l2Q3UXB0 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mbd3l2Q3UXB0 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mbd3l2Q3UXB0 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mbd3l2Q3UXB0 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mbd3l2Q3UXB0 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mbd3l2Q3UXB0 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mbd3l2Q3UXB0 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mbd3l2Q3UXB0 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mbd3l2Q3UXB0 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mbd3l2Q3UXB0 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mbd3l2Q3UXB0 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mbd3l2Q3UXB0 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mbd3l2Q3UXB0 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mbd3l2Q3UXB0 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mbd3l2Q3UXB0 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mbd3l2Q3UXB0 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Mbd3l2Q3UXB0 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mbd3l2Q3UXB0 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mbd3l2Q3UXB0 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mbd3l2Q3UXB0 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mbd3l2Q3UXB0 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mbd3l2Q3UXB0 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mbd3l2Q3UXB0 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mbd3l2Q3UXB0 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mbd3l2Q3UXB0 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mbd3l2Q3UXB0 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mbd3l2Q3UXB0 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Mbd3l2Q3UXB0 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mbd3l2Q3UXB0 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mbd3l2Q3UXB0 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mbd3l2Q3UXB0 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mbd3l2Q3UXB0 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mbd3l2Q3UXB0 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mbd3l2Q3UXB0 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mbd3l2Q3UXB0 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mbd3l2Q3UXB0 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mbd3l2Q3UXB0 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mbd3l2Q3UXB0 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Mbd3l2Q3UXB0 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mbd3l2Q3UXB0 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mbd3l2Q3UXB0 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mbd3l2Q3UXB0 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mbd3l2Q3UXB0 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mbd3l2Q3UXB0 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mbd3l2Q3UXB0 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mbd3l2Q3UXB0 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mbd3l2Q3UXB0 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.2 ms