Protein–RNA interactions for Protein: Q3UUV9

H2-Eb2, Histocompatibility 2, class II antigen E beta2, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb2Q3UUV9 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
H2-Eb2Q3UUV9 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
H2-Eb2Q3UUV9 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
H2-Eb2Q3UUV9 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
H2-Eb2Q3UUV9 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
H2-Eb2Q3UUV9 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
H2-Eb2Q3UUV9 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
H2-Eb2Q3UUV9 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
H2-Eb2Q3UUV9 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
H2-Eb2Q3UUV9 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
H2-Eb2Q3UUV9 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
H2-Eb2Q3UUV9 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
H2-Eb2Q3UUV9 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
H2-Eb2Q3UUV9 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
H2-Eb2Q3UUV9 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
H2-Eb2Q3UUV9 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
H2-Eb2Q3UUV9 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
H2-Eb2Q3UUV9 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
H2-Eb2Q3UUV9 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
H2-Eb2Q3UUV9 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
H2-Eb2Q3UUV9 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
H2-Eb2Q3UUV9 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
H2-Eb2Q3UUV9 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
H2-Eb2Q3UUV9 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
H2-Eb2Q3UUV9 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
H2-Eb2Q3UUV9 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
H2-Eb2Q3UUV9 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
H2-Eb2Q3UUV9 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
H2-Eb2Q3UUV9 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
H2-Eb2Q3UUV9 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
H2-Eb2Q3UUV9 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
H2-Eb2Q3UUV9 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
H2-Eb2Q3UUV9 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
H2-Eb2Q3UUV9 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
H2-Eb2Q3UUV9 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
H2-Eb2Q3UUV9 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
H2-Eb2Q3UUV9 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
H2-Eb2Q3UUV9 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
H2-Eb2Q3UUV9 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
H2-Eb2Q3UUV9 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
H2-Eb2Q3UUV9 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
H2-Eb2Q3UUV9 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
H2-Eb2Q3UUV9 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
H2-Eb2Q3UUV9 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
H2-Eb2Q3UUV9 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
H2-Eb2Q3UUV9 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
H2-Eb2Q3UUV9 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
H2-Eb2Q3UUV9 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
H2-Eb2Q3UUV9 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
H2-Eb2Q3UUV9 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
H2-Eb2Q3UUV9 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
H2-Eb2Q3UUV9 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
H2-Eb2Q3UUV9 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
H2-Eb2Q3UUV9 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
H2-Eb2Q3UUV9 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
H2-Eb2Q3UUV9 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
H2-Eb2Q3UUV9 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
H2-Eb2Q3UUV9 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
H2-Eb2Q3UUV9 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
H2-Eb2Q3UUV9 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
H2-Eb2Q3UUV9 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
H2-Eb2Q3UUV9 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
H2-Eb2Q3UUV9 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
H2-Eb2Q3UUV9 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
H2-Eb2Q3UUV9 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
H2-Eb2Q3UUV9 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
H2-Eb2Q3UUV9 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
H2-Eb2Q3UUV9 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
H2-Eb2Q3UUV9 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
H2-Eb2Q3UUV9 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
H2-Eb2Q3UUV9 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
H2-Eb2Q3UUV9 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
H2-Eb2Q3UUV9 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
H2-Eb2Q3UUV9 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
H2-Eb2Q3UUV9 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
H2-Eb2Q3UUV9 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
H2-Eb2Q3UUV9 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
H2-Eb2Q3UUV9 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
H2-Eb2Q3UUV9 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
H2-Eb2Q3UUV9 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
H2-Eb2Q3UUV9 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
H2-Eb2Q3UUV9 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
H2-Eb2Q3UUV9 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
H2-Eb2Q3UUV9 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
H2-Eb2Q3UUV9 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
H2-Eb2Q3UUV9 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
H2-Eb2Q3UUV9 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
H2-Eb2Q3UUV9 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
H2-Eb2Q3UUV9 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
H2-Eb2Q3UUV9 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
H2-Eb2Q3UUV9 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
H2-Eb2Q3UUV9 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
H2-Eb2Q3UUV9 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
H2-Eb2Q3UUV9 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
H2-Eb2Q3UUV9 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
H2-Eb2Q3UUV9 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
H2-Eb2Q3UUV9 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
H2-Eb2Q3UUV9 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
H2-Eb2Q3UUV9 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
H2-Eb2Q3UUV9 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms