Protein–RNA interactions for Protein: Q3UM29

Cog7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog7Q3UM29 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cog7Q3UM29 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cog7Q3UM29 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cog7Q3UM29 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cog7Q3UM29 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cog7Q3UM29 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cog7Q3UM29 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cog7Q3UM29 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cog7Q3UM29 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cog7Q3UM29 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Cog7Q3UM29 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cog7Q3UM29 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cog7Q3UM29 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Cog7Q3UM29 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cog7Q3UM29 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cog7Q3UM29 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cog7Q3UM29 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cog7Q3UM29 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cog7Q3UM29 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cog7Q3UM29 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cog7Q3UM29 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cog7Q3UM29 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cog7Q3UM29 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cog7Q3UM29 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cog7Q3UM29 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cog7Q3UM29 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cog7Q3UM29 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cog7Q3UM29 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cog7Q3UM29 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cog7Q3UM29 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Cog7Q3UM29 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cog7Q3UM29 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cog7Q3UM29 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cog7Q3UM29 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cog7Q3UM29 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cog7Q3UM29 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cog7Q3UM29 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cog7Q3UM29 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cog7Q3UM29 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cog7Q3UM29 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cog7Q3UM29 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cog7Q3UM29 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cog7Q3UM29 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cog7Q3UM29 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cog7Q3UM29 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cog7Q3UM29 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cog7Q3UM29 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cog7Q3UM29 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cog7Q3UM29 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cog7Q3UM29 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cog7Q3UM29 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cog7Q3UM29 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cog7Q3UM29 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cog7Q3UM29 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cog7Q3UM29 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Cog7Q3UM29 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cog7Q3UM29 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cog7Q3UM29 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cog7Q3UM29 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cog7Q3UM29 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cog7Q3UM29 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cog7Q3UM29 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Cog7Q3UM29 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cog7Q3UM29 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cog7Q3UM29 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cog7Q3UM29 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cog7Q3UM29 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cog7Q3UM29 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cog7Q3UM29 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cog7Q3UM29 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cog7Q3UM29 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cog7Q3UM29 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cog7Q3UM29 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cog7Q3UM29 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cog7Q3UM29 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cog7Q3UM29 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cog7Q3UM29 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cog7Q3UM29 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cog7Q3UM29 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cog7Q3UM29 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cog7Q3UM29 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cog7Q3UM29 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cog7Q3UM29 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cog7Q3UM29 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cog7Q3UM29 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cog7Q3UM29 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cog7Q3UM29 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cog7Q3UM29 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cog7Q3UM29 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cog7Q3UM29 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cog7Q3UM29 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cog7Q3UM29 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cog7Q3UM29 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cog7Q3UM29 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cog7Q3UM29 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cog7Q3UM29 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cog7Q3UM29 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cog7Q3UM29 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cog7Q3UM29 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cog7Q3UM29 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms