Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHI4

Tmed8, Protein TMED8, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed8Q3UHI4 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tmed8Q3UHI4 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tmed8Q3UHI4 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tmed8Q3UHI4 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tmed8Q3UHI4 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tmed8Q3UHI4 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tmed8Q3UHI4 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tmed8Q3UHI4 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tmed8Q3UHI4 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tmed8Q3UHI4 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Tmed8Q3UHI4 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tmed8Q3UHI4 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Tmed8Q3UHI4 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tmed8Q3UHI4 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tmed8Q3UHI4 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tmed8Q3UHI4 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Tmed8Q3UHI4 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tmed8Q3UHI4 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tmed8Q3UHI4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tmed8Q3UHI4 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tmed8Q3UHI4 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tmed8Q3UHI4 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Tmed8Q3UHI4 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tmed8Q3UHI4 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tmed8Q3UHI4 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tmed8Q3UHI4 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tmed8Q3UHI4 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tmed8Q3UHI4 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tmed8Q3UHI4 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tmed8Q3UHI4 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tmed8Q3UHI4 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tmed8Q3UHI4 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tmed8Q3UHI4 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tmed8Q3UHI4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tmed8Q3UHI4 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Tmed8Q3UHI4 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tmed8Q3UHI4 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tmed8Q3UHI4 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tmed8Q3UHI4 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tmed8Q3UHI4 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tmed8Q3UHI4 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tmed8Q3UHI4 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tmed8Q3UHI4 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tmed8Q3UHI4 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tmed8Q3UHI4 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tmed8Q3UHI4 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tmed8Q3UHI4 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tmed8Q3UHI4 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tmed8Q3UHI4 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tmed8Q3UHI4 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tmed8Q3UHI4 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Tmed8Q3UHI4 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tmed8Q3UHI4 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tmed8Q3UHI4 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tmed8Q3UHI4 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tmed8Q3UHI4 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tmed8Q3UHI4 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tmed8Q3UHI4 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tmed8Q3UHI4 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tmed8Q3UHI4 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tmed8Q3UHI4 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Tmed8Q3UHI4 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tmed8Q3UHI4 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tmed8Q3UHI4 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Tmed8Q3UHI4 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tmed8Q3UHI4 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tmed8Q3UHI4 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tmed8Q3UHI4 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tmed8Q3UHI4 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tmed8Q3UHI4 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tmed8Q3UHI4 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tmed8Q3UHI4 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tmed8Q3UHI4 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Tmed8Q3UHI4 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tmed8Q3UHI4 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tmed8Q3UHI4 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tmed8Q3UHI4 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tmed8Q3UHI4 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tmed8Q3UHI4 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tmed8Q3UHI4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tmed8Q3UHI4 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tmed8Q3UHI4 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tmed8Q3UHI4 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Tmed8Q3UHI4 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tmed8Q3UHI4 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tmed8Q3UHI4 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tmed8Q3UHI4 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tmed8Q3UHI4 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Tmed8Q3UHI4 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tmed8Q3UHI4 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tmed8Q3UHI4 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tmed8Q3UHI4 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tmed8Q3UHI4 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tmed8Q3UHI4 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tmed8Q3UHI4 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tmed8Q3UHI4 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tmed8Q3UHI4 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tmed8Q3UHI4 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tmed8Q3UHI4 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tmed8Q3UHI4 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms