Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHH1

Zswim8, Zinc finger SWIM domain-containing protein 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zswim8Q3UHH1 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Zswim8Q3UHH1 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Zswim8Q3UHH1 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Zswim8Q3UHH1 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Zswim8Q3UHH1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Zswim8Q3UHH1 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Zswim8Q3UHH1 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Zswim8Q3UHH1 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Zswim8Q3UHH1 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Zswim8Q3UHH1 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Zswim8Q3UHH1 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Zswim8Q3UHH1 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Zswim8Q3UHH1 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Zswim8Q3UHH1 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
Zswim8Q3UHH1 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Zswim8Q3UHH1 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Zswim8Q3UHH1 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Zswim8Q3UHH1 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Zswim8Q3UHH1 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Zswim8Q3UHH1 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Zswim8Q3UHH1 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Zswim8Q3UHH1 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Zswim8Q3UHH1 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Zswim8Q3UHH1 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Zswim8Q3UHH1 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Zswim8Q3UHH1 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Zswim8Q3UHH1 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Zswim8Q3UHH1 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Zswim8Q3UHH1 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Zswim8Q3UHH1 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Zswim8Q3UHH1 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Zswim8Q3UHH1 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Zswim8Q3UHH1 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Zswim8Q3UHH1 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Zswim8Q3UHH1 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Zswim8Q3UHH1 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Zswim8Q3UHH1 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Zswim8Q3UHH1 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Zswim8Q3UHH1 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Zswim8Q3UHH1 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Zswim8Q3UHH1 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Zswim8Q3UHH1 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Zswim8Q3UHH1 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Zswim8Q3UHH1 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Zswim8Q3UHH1 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Zswim8Q3UHH1 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Zswim8Q3UHH1 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Zswim8Q3UHH1 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Zswim8Q3UHH1 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Zswim8Q3UHH1 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Zswim8Q3UHH1 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Zswim8Q3UHH1 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Zswim8Q3UHH1 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Zswim8Q3UHH1 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Zswim8Q3UHH1 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Zswim8Q3UHH1 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Zswim8Q3UHH1 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Zswim8Q3UHH1 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Zswim8Q3UHH1 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Zswim8Q3UHH1 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Zswim8Q3UHH1 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Zswim8Q3UHH1 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Zswim8Q3UHH1 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Zswim8Q3UHH1 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Zswim8Q3UHH1 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Zswim8Q3UHH1 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Zswim8Q3UHH1 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Zswim8Q3UHH1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Zswim8Q3UHH1 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Zswim8Q3UHH1 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Zswim8Q3UHH1 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Zswim8Q3UHH1 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Zswim8Q3UHH1 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Zswim8Q3UHH1 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Zswim8Q3UHH1 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Zswim8Q3UHH1 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Zswim8Q3UHH1 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Zswim8Q3UHH1 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Zswim8Q3UHH1 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Zswim8Q3UHH1 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Zswim8Q3UHH1 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Zswim8Q3UHH1 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Zswim8Q3UHH1 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Zswim8Q3UHH1 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Zswim8Q3UHH1 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Zswim8Q3UHH1 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Zswim8Q3UHH1 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Zswim8Q3UHH1 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Zswim8Q3UHH1 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Zswim8Q3UHH1 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Zswim8Q3UHH1 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Zswim8Q3UHH1 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Zswim8Q3UHH1 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Zswim8Q3UHH1 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Zswim8Q3UHH1 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Zswim8Q3UHH1 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Zswim8Q3UHH1 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Zswim8Q3UHH1 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Zswim8Q3UHH1 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Zswim8Q3UHH1 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms