Protein–RNA interactions for Protein: Q3U898

Cops9, COP9 signalosome complex subunit 9, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops9Q3U898 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cops9Q3U898 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cops9Q3U898 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Cops9Q3U898 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cops9Q3U898 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cops9Q3U898 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cops9Q3U898 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cops9Q3U898 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cops9Q3U898 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cops9Q3U898 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cops9Q3U898 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cops9Q3U898 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Cops9Q3U898 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cops9Q3U898 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Cops9Q3U898 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cops9Q3U898 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cops9Q3U898 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cops9Q3U898 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cops9Q3U898 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cops9Q3U898 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cops9Q3U898 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cops9Q3U898 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cops9Q3U898 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cops9Q3U898 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cops9Q3U898 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cops9Q3U898 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cops9Q3U898 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cops9Q3U898 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cops9Q3U898 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cops9Q3U898 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cops9Q3U898 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cops9Q3U898 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cops9Q3U898 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cops9Q3U898 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Cops9Q3U898 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cops9Q3U898 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Cops9Q3U898 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cops9Q3U898 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cops9Q3U898 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cops9Q3U898 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cops9Q3U898 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cops9Q3U898 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cops9Q3U898 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cops9Q3U898 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cops9Q3U898 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cops9Q3U898 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cops9Q3U898 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cops9Q3U898 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cops9Q3U898 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cops9Q3U898 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cops9Q3U898 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cops9Q3U898 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cops9Q3U898 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cops9Q3U898 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cops9Q3U898 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cops9Q3U898 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cops9Q3U898 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cops9Q3U898 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cops9Q3U898 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Cops9Q3U898 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cops9Q3U898 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cops9Q3U898 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cops9Q3U898 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cops9Q3U898 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cops9Q3U898 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cops9Q3U898 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cops9Q3U898 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cops9Q3U898 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cops9Q3U898 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cops9Q3U898 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cops9Q3U898 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cops9Q3U898 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cops9Q3U898 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cops9Q3U898 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Cops9Q3U898 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cops9Q3U898 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cops9Q3U898 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cops9Q3U898 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cops9Q3U898 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cops9Q3U898 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cops9Q3U898 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cops9Q3U898 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cops9Q3U898 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cops9Q3U898 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cops9Q3U898 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cops9Q3U898 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cops9Q3U898 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cops9Q3U898 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cops9Q3U898 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cops9Q3U898 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cops9Q3U898 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cops9Q3U898 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cops9Q3U898 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cops9Q3U898 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cops9Q3U898 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cops9Q3U898 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cops9Q3U898 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cops9Q3U898 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cops9Q3U898 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cops9Q3U898 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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