Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3R4

Lmf1, Lipase maturation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmf1Q3U3R4 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lmf1Q3U3R4 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lmf1Q3U3R4 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lmf1Q3U3R4 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lmf1Q3U3R4 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lmf1Q3U3R4 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lmf1Q3U3R4 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lmf1Q3U3R4 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lmf1Q3U3R4 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lmf1Q3U3R4 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lmf1Q3U3R4 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lmf1Q3U3R4 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lmf1Q3U3R4 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lmf1Q3U3R4 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lmf1Q3U3R4 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lmf1Q3U3R4 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lmf1Q3U3R4 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Lmf1Q3U3R4 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lmf1Q3U3R4 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lmf1Q3U3R4 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lmf1Q3U3R4 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lmf1Q3U3R4 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lmf1Q3U3R4 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lmf1Q3U3R4 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lmf1Q3U3R4 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lmf1Q3U3R4 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lmf1Q3U3R4 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lmf1Q3U3R4 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lmf1Q3U3R4 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lmf1Q3U3R4 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lmf1Q3U3R4 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Lmf1Q3U3R4 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lmf1Q3U3R4 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lmf1Q3U3R4 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lmf1Q3U3R4 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lmf1Q3U3R4 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lmf1Q3U3R4 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lmf1Q3U3R4 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lmf1Q3U3R4 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lmf1Q3U3R4 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lmf1Q3U3R4 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lmf1Q3U3R4 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lmf1Q3U3R4 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lmf1Q3U3R4 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lmf1Q3U3R4 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lmf1Q3U3R4 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lmf1Q3U3R4 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lmf1Q3U3R4 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lmf1Q3U3R4 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lmf1Q3U3R4 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lmf1Q3U3R4 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lmf1Q3U3R4 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lmf1Q3U3R4 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lmf1Q3U3R4 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lmf1Q3U3R4 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lmf1Q3U3R4 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lmf1Q3U3R4 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lmf1Q3U3R4 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lmf1Q3U3R4 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lmf1Q3U3R4 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lmf1Q3U3R4 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lmf1Q3U3R4 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lmf1Q3U3R4 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lmf1Q3U3R4 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lmf1Q3U3R4 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lmf1Q3U3R4 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lmf1Q3U3R4 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lmf1Q3U3R4 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lmf1Q3U3R4 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lmf1Q3U3R4 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lmf1Q3U3R4 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lmf1Q3U3R4 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lmf1Q3U3R4 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lmf1Q3U3R4 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lmf1Q3U3R4 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Lmf1Q3U3R4 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lmf1Q3U3R4 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lmf1Q3U3R4 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lmf1Q3U3R4 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lmf1Q3U3R4 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lmf1Q3U3R4 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lmf1Q3U3R4 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lmf1Q3U3R4 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lmf1Q3U3R4 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lmf1Q3U3R4 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lmf1Q3U3R4 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lmf1Q3U3R4 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lmf1Q3U3R4 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lmf1Q3U3R4 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lmf1Q3U3R4 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lmf1Q3U3R4 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lmf1Q3U3R4 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Lmf1Q3U3R4 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lmf1Q3U3R4 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lmf1Q3U3R4 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lmf1Q3U3R4 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lmf1Q3U3R4 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lmf1Q3U3R4 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lmf1Q3U3R4 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lmf1Q3U3R4 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms