Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0D9

Hace1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hace1Q3U0D9 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hace1Q3U0D9 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hace1Q3U0D9 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hace1Q3U0D9 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Hace1Q3U0D9 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hace1Q3U0D9 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hace1Q3U0D9 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hace1Q3U0D9 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hace1Q3U0D9 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hace1Q3U0D9 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hace1Q3U0D9 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hace1Q3U0D9 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hace1Q3U0D9 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hace1Q3U0D9 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hace1Q3U0D9 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hace1Q3U0D9 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Hace1Q3U0D9 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Hace1Q3U0D9 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Hace1Q3U0D9 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hace1Q3U0D9 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hace1Q3U0D9 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hace1Q3U0D9 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hace1Q3U0D9 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hace1Q3U0D9 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hace1Q3U0D9 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Hace1Q3U0D9 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Hace1Q3U0D9 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hace1Q3U0D9 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hace1Q3U0D9 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hace1Q3U0D9 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hace1Q3U0D9 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hace1Q3U0D9 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hace1Q3U0D9 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Hace1Q3U0D9 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hace1Q3U0D9 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hace1Q3U0D9 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hace1Q3U0D9 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hace1Q3U0D9 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hace1Q3U0D9 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hace1Q3U0D9 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hace1Q3U0D9 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hace1Q3U0D9 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Hace1Q3U0D9 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hace1Q3U0D9 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hace1Q3U0D9 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Hace1Q3U0D9 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hace1Q3U0D9 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hace1Q3U0D9 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hace1Q3U0D9 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hace1Q3U0D9 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hace1Q3U0D9 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hace1Q3U0D9 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hace1Q3U0D9 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hace1Q3U0D9 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hace1Q3U0D9 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hace1Q3U0D9 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hace1Q3U0D9 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hace1Q3U0D9 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hace1Q3U0D9 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hace1Q3U0D9 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hace1Q3U0D9 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hace1Q3U0D9 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hace1Q3U0D9 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hace1Q3U0D9 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Hace1Q3U0D9 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hace1Q3U0D9 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hace1Q3U0D9 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hace1Q3U0D9 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hace1Q3U0D9 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hace1Q3U0D9 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hace1Q3U0D9 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hace1Q3U0D9 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Hace1Q3U0D9 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Hace1Q3U0D9 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hace1Q3U0D9 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hace1Q3U0D9 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hace1Q3U0D9 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hace1Q3U0D9 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hace1Q3U0D9 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hace1Q3U0D9 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hace1Q3U0D9 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hace1Q3U0D9 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hace1Q3U0D9 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hace1Q3U0D9 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hace1Q3U0D9 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hace1Q3U0D9 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hace1Q3U0D9 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hace1Q3U0D9 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hace1Q3U0D9 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hace1Q3U0D9 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hace1Q3U0D9 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hace1Q3U0D9 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hace1Q3U0D9 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hace1Q3U0D9 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hace1Q3U0D9 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hace1Q3U0D9 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hace1Q3U0D9 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hace1Q3U0D9 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hace1Q3U0D9 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hace1Q3U0D9 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69 ms