Protein–RNA interactions for Protein: Q3TEI4

Uncharacterized protein C15orf39 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,023 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TEI4 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q3TEI4 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q3TEI4 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q3TEI4 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q3TEI4 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q3TEI4 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q3TEI4 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q3TEI4 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q3TEI4 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q3TEI4 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q3TEI4 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q3TEI4 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q3TEI4 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q3TEI4 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q3TEI4 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q3TEI4 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q3TEI4 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q3TEI4 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q3TEI4 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q3TEI4 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q3TEI4 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q3TEI4 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q3TEI4 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q3TEI4 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q3TEI4 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q3TEI4 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q3TEI4 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q3TEI4 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q3TEI4 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q3TEI4 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q3TEI4 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q3TEI4 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q3TEI4 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q3TEI4 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q3TEI4 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q3TEI4 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q3TEI4 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q3TEI4 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q3TEI4 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q3TEI4 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q3TEI4 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q3TEI4 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q3TEI4 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q3TEI4 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q3TEI4 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q3TEI4 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q3TEI4 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q3TEI4 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q3TEI4 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q3TEI4 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q3TEI4 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q3TEI4 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q3TEI4 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q3TEI4 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q3TEI4 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q3TEI4 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q3TEI4 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q3TEI4 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Q3TEI4 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Q3TEI4 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q3TEI4 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q3TEI4 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q3TEI4 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q3TEI4 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q3TEI4 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q3TEI4 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q3TEI4 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Q3TEI4 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q3TEI4 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q3TEI4 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q3TEI4 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q3TEI4 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q3TEI4 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q3TEI4 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q3TEI4 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q3TEI4 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q3TEI4 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q3TEI4 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q3TEI4 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q3TEI4 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q3TEI4 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q3TEI4 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q3TEI4 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q3TEI4 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q3TEI4 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q3TEI4 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q3TEI4 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q3TEI4 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q3TEI4 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q3TEI4 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q3TEI4 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q3TEI4 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q3TEI4 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q3TEI4 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q3TEI4 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q3TEI4 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q3TEI4 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q3TEI4 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q3TEI4 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q3TEI4 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.1 ms