Protein–RNA interactions for Protein: Q32KG4

Rtl9, Retrotransposon Gag-like protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl9Q32KG4 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rtl9Q32KG4 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rtl9Q32KG4 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rtl9Q32KG4 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rtl9Q32KG4 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rtl9Q32KG4 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rtl9Q32KG4 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rtl9Q32KG4 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rtl9Q32KG4 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rtl9Q32KG4 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rtl9Q32KG4 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rtl9Q32KG4 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rtl9Q32KG4 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rtl9Q32KG4 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rtl9Q32KG4 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rtl9Q32KG4 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rtl9Q32KG4 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rtl9Q32KG4 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rtl9Q32KG4 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rtl9Q32KG4 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rtl9Q32KG4 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rtl9Q32KG4 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rtl9Q32KG4 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rtl9Q32KG4 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rtl9Q32KG4 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Rtl9Q32KG4 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rtl9Q32KG4 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rtl9Q32KG4 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rtl9Q32KG4 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rtl9Q32KG4 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rtl9Q32KG4 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rtl9Q32KG4 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rtl9Q32KG4 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rtl9Q32KG4 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rtl9Q32KG4 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rtl9Q32KG4 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rtl9Q32KG4 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rtl9Q32KG4 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rtl9Q32KG4 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rtl9Q32KG4 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rtl9Q32KG4 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rtl9Q32KG4 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rtl9Q32KG4 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rtl9Q32KG4 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Rtl9Q32KG4 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rtl9Q32KG4 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rtl9Q32KG4 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rtl9Q32KG4 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rtl9Q32KG4 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rtl9Q32KG4 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rtl9Q32KG4 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Rtl9Q32KG4 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rtl9Q32KG4 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rtl9Q32KG4 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rtl9Q32KG4 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rtl9Q32KG4 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rtl9Q32KG4 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rtl9Q32KG4 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rtl9Q32KG4 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rtl9Q32KG4 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rtl9Q32KG4 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rtl9Q32KG4 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rtl9Q32KG4 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Rtl9Q32KG4 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rtl9Q32KG4 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rtl9Q32KG4 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rtl9Q32KG4 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rtl9Q32KG4 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rtl9Q32KG4 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rtl9Q32KG4 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rtl9Q32KG4 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rtl9Q32KG4 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rtl9Q32KG4 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rtl9Q32KG4 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rtl9Q32KG4 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rtl9Q32KG4 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rtl9Q32KG4 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rtl9Q32KG4 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rtl9Q32KG4 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rtl9Q32KG4 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rtl9Q32KG4 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rtl9Q32KG4 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rtl9Q32KG4 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rtl9Q32KG4 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rtl9Q32KG4 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rtl9Q32KG4 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rtl9Q32KG4 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rtl9Q32KG4 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rtl9Q32KG4 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rtl9Q32KG4 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rtl9Q32KG4 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rtl9Q32KG4 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rtl9Q32KG4 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Rtl9Q32KG4 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rtl9Q32KG4 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rtl9Q32KG4 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rtl9Q32KG4 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rtl9Q32KG4 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rtl9Q32KG4 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rtl9Q32KG4 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.5 ms