Protein–RNA interactions for Protein: Q09324

Gcnt1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcnt1Q09324 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Gcnt1Q09324 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gcnt1Q09324 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gcnt1Q09324 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Gcnt1Q09324 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gcnt1Q09324 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gcnt1Q09324 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gcnt1Q09324 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gcnt1Q09324 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gcnt1Q09324 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gcnt1Q09324 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gcnt1Q09324 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gcnt1Q09324 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gcnt1Q09324 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gcnt1Q09324 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gcnt1Q09324 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gcnt1Q09324 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gcnt1Q09324 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gcnt1Q09324 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Gcnt1Q09324 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gcnt1Q09324 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gcnt1Q09324 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gcnt1Q09324 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gcnt1Q09324 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gcnt1Q09324 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gcnt1Q09324 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gcnt1Q09324 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gcnt1Q09324 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gcnt1Q09324 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gcnt1Q09324 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gcnt1Q09324 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Gcnt1Q09324 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Gcnt1Q09324 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gcnt1Q09324 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gcnt1Q09324 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gcnt1Q09324 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gcnt1Q09324 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gcnt1Q09324 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gcnt1Q09324 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gcnt1Q09324 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gcnt1Q09324 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gcnt1Q09324 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gcnt1Q09324 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gcnt1Q09324 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gcnt1Q09324 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gcnt1Q09324 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gcnt1Q09324 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gcnt1Q09324 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gcnt1Q09324 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gcnt1Q09324 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gcnt1Q09324 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gcnt1Q09324 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gcnt1Q09324 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gcnt1Q09324 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gcnt1Q09324 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gcnt1Q09324 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gcnt1Q09324 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gcnt1Q09324 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Gcnt1Q09324 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gcnt1Q09324 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gcnt1Q09324 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gcnt1Q09324 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gcnt1Q09324 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gcnt1Q09324 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gcnt1Q09324 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gcnt1Q09324 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gcnt1Q09324 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Gcnt1Q09324 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Gcnt1Q09324 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gcnt1Q09324 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gcnt1Q09324 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Gcnt1Q09324 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gcnt1Q09324 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gcnt1Q09324 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gcnt1Q09324 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gcnt1Q09324 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gcnt1Q09324 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gcnt1Q09324 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gcnt1Q09324 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gcnt1Q09324 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gcnt1Q09324 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gcnt1Q09324 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Gcnt1Q09324 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gcnt1Q09324 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Gcnt1Q09324 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gcnt1Q09324 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gcnt1Q09324 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gcnt1Q09324 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gcnt1Q09324 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gcnt1Q09324 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gcnt1Q09324 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gcnt1Q09324 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Gcnt1Q09324 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gcnt1Q09324 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gcnt1Q09324 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gcnt1Q09324 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gcnt1Q09324 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gcnt1Q09324 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Gcnt1Q09324 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gcnt1Q09324 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms