Protein–RNA interactions for Protein: Q08535

Sct, Secretin, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SctQ08535 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SctQ08535 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SctQ08535 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SctQ08535 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SctQ08535 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SctQ08535 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SctQ08535 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SctQ08535 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
SctQ08535 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SctQ08535 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
SctQ08535 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SctQ08535 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SctQ08535 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SctQ08535 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SctQ08535 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SctQ08535 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SctQ08535 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SctQ08535 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SctQ08535 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SctQ08535 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SctQ08535 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SctQ08535 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SctQ08535 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SctQ08535 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SctQ08535 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SctQ08535 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SctQ08535 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SctQ08535 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SctQ08535 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SctQ08535 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SctQ08535 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SctQ08535 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SctQ08535 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SctQ08535 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SctQ08535 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SctQ08535 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SctQ08535 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SctQ08535 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SctQ08535 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SctQ08535 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SctQ08535 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SctQ08535 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SctQ08535 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SctQ08535 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SctQ08535 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SctQ08535 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SctQ08535 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SctQ08535 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SctQ08535 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SctQ08535 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SctQ08535 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SctQ08535 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SctQ08535 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SctQ08535 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SctQ08535 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SctQ08535 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SctQ08535 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SctQ08535 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SctQ08535 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SctQ08535 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SctQ08535 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SctQ08535 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SctQ08535 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SctQ08535 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SctQ08535 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SctQ08535 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SctQ08535 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SctQ08535 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SctQ08535 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SctQ08535 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SctQ08535 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SctQ08535 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SctQ08535 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SctQ08535 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SctQ08535 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SctQ08535 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SctQ08535 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SctQ08535 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SctQ08535 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SctQ08535 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SctQ08535 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SctQ08535 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SctQ08535 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SctQ08535 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SctQ08535 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SctQ08535 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SctQ08535 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SctQ08535 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SctQ08535 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SctQ08535 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SctQ08535 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SctQ08535 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SctQ08535 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SctQ08535 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SctQ08535 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SctQ08535 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SctQ08535 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SctQ08535 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SctQ08535 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SctQ08535 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.6 ms