Protein–RNA interactions for Protein: Q07084

SSK1, Osmolarity two-component system protein SSK1, yeastyeast

Predictions only

Length 712 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSK1Q07084 RPL10YLR075W 666 nt5.42□□□□□ -1.54
SSK1Q07084 ELC1YPL046C 300 nt5.42□□□□□ -1.54
SSK1Q07084 ALG5YPL227C 1005 nt5.42□□□□□ -1.54
SSK1Q07084 HAL1YPR005C 885 nt5.42□□□□□ -1.54
SSK1Q07084 YBR298C-AYBR298C-A 222 nt5.42□□□□□ -1.54
SSK1Q07084 ASN1YPR145W 1719 nt5.42□□□□□ -1.54
SSK1Q07084 FRS2YFL022C 1512 nt5.42□□□□□ -1.54
SSK1Q07084 CLB4YLR210W 1383 nt5.42□□□□□ -1.54
SSK1Q07084 NHA1YLR138W 2958 nt5.41□□□□□ -1.54
SSK1Q07084 RRP9YPR137W 1722 nt5.41□□□□□ -1.54
SSK1Q07084 YIR020W-AYIR020W-A 243 nt5.41□□□□□ -1.54
SSK1Q07084 ATG18YFR021W 1503 nt5.41□□□□□ -1.54
SSK1Q07084 ZWF1YNL241C 1518 nt5.41□□□□□ -1.54
SSK1Q07084 HSP104YLL026W 2727 nt5.41□□□□□ -1.54
SSK1Q07084 MCM6YGL201C 3054 nt5.41□□□□□ -1.54
SSK1Q07084 XBP1YIL101C 1944 nt5.4□□□□□ -1.54
SSK1Q07084 RNR3YIL066C 2610 nt5.4□□□□□ -1.54
SSK1Q07084 FYV1YDR024W 486 nt5.4□□□□□ -1.54
SSK1Q07084 SNF11YDR073W 510 nt5.4□□□□□ -1.54
SSK1Q07084 YER147C-AYER147C-A 411 nt5.4□□□□□ -1.54
SSK1Q07084 TFG2YGR005C 1203 nt5.4□□□□□ -1.54
SSK1Q07084 SPG1YGR236C 288 nt5.4□□□□□ -1.54
SSK1Q07084 SUP2tY(GUA)D 75 nt5.4□□□□□ -1.54
SSK1Q07084 SUP11tY(GUA)F1 75 nt5.4□□□□□ -1.54
SSK1Q07084 SUP6tY(GUA)F2 75 nt5.4□□□□□ -1.54
SSK1Q07084 SUP7tY(GUA)J1 75 nt5.4□□□□□ -1.54
SSK1Q07084 SUP4tY(GUA)J2 75 nt5.4□□□□□ -1.54
SSK1Q07084 SUP5tY(GUA)M1 75 nt5.4□□□□□ -1.54
SSK1Q07084 SUP8tY(GUA)M2 75 nt5.4□□□□□ -1.54
SSK1Q07084 SUP3tY(GUA)O 75 nt5.4□□□□□ -1.54
SSK1Q07084 YJR115WYJR115W 510 nt5.4□□□□□ -1.54
SSK1Q07084 ODC2YOR222W 924 nt5.4□□□□□ -1.54
SSK1Q07084 YBR124WYBR124W 360 nt5.4□□□□□ -1.54
SSK1Q07084 UTP6YDR449C 1323 nt5.4□□□□□ -1.55
SSK1Q07084 HST3YOR025W 1344 nt5.4□□□□□ -1.55
SSK1Q07084 TIM22YDL217C 624 nt5.39□□□□□ -1.55
SSK1Q07084 CDC34YDR054C 888 nt5.39□□□□□ -1.55
SSK1Q07084 TDH2YJR009C 999 nt5.39□□□□□ -1.55
SSK1Q07084 PHA2YNL316C 1005 nt5.39□□□□□ -1.55
SSK1Q07084 DSE3YOR264W 1293 nt5.39□□□□□ -1.55
SSK1Q07084 PKC1YBL105C 3456 nt5.39□□□□□ -1.55
SSK1Q07084 GPI18YBR004C 1302 nt5.39□□□□□ -1.55
SSK1Q07084 BSC5YNR069C 1470 nt5.39□□□□□ -1.55
SSK1Q07084 RCK1YGL158W 1539 nt5.38□□□□□ -1.55
SSK1Q07084 EIS1YMR031C 2532 nt5.38□□□□□ -1.55
SSK1Q07084 MDM31YHR194W 1740 nt5.38□□□□□ -1.55
SSK1Q07084 SCT1YBL011W 2280 nt5.38□□□□□ -1.55
SSK1Q07084 MPC2YHR162W 390 nt5.38□□□□□ -1.55
SSK1Q07084 YNR068CYNR068C 819 nt5.38□□□□□ -1.55
SSK1Q07084 MRP51YPL118W 1035 nt5.38□□□□□ -1.55
SSK1Q07084 PCL10YGL134W 1302 nt5.38□□□□□ -1.55
SSK1Q07084 YMR027WYMR027W 1413 nt5.38□□□□□ -1.55
SSK1Q07084 YPR196WYPR196W 1413 nt5.38□□□□□ -1.55
SSK1Q07084 RAD3YER171W 2337 nt5.37□□□□□ -1.55
SSK1Q07084 FLC3YGL139W 2409 nt5.37□□□□□ -1.55
SSK1Q07084 YLL067CYLL067C 3618 nt5.37□□□□□ -1.55
SSK1Q07084 YEA6YEL006W 1008 nt5.37□□□□□ -1.55
SSK1Q07084 YHL018WYHL018W 363 nt5.37□□□□□ -1.55
SSK1Q07084 YJL107CYJL107C 1164 nt5.37□□□□□ -1.55
SSK1Q07084 CDC11YJR076C 1248 nt5.37□□□□□ -1.55
SSK1Q07084 VPS24YKL041W 675 nt5.37□□□□□ -1.55
SSK1Q07084 TAL1YLR354C 1008 nt5.37□□□□□ -1.55
SSK1Q07084 YNL228WYNL228W 777 nt5.37□□□□□ -1.55
SSK1Q07084 RRS1YOR294W 612 nt5.37□□□□□ -1.55
SSK1Q07084 RVB2YPL235W 1416 nt5.37□□□□□ -1.55
SSK1Q07084 BPL1YDL141W 2073 nt5.36□□□□□ -1.55
SSK1Q07084 YNL247WYNL247W 2304 nt5.36□□□□□ -1.55
SSK1Q07084 YCR006CYCR006C 474 nt5.36□□□□□ -1.55
SSK1Q07084 YDL023CYDL023C 321 nt5.36□□□□□ -1.55
SSK1Q07084 YEL068CYEL068C 333 nt5.36□□□□□ -1.55
SSK1Q07084 CHO1YER026C 831 nt5.36□□□□□ -1.55
SSK1Q07084 ECM14YHR132C 1293 nt5.36□□□□□ -1.55
SSK1Q07084 ISY1YJR050W 708 nt5.36□□□□□ -1.55
SSK1Q07084 YJU2YKL095W 837 nt5.36□□□□□ -1.55
SSK1Q07084 RHO4YKR055W 876 nt5.36□□□□□ -1.55
SSK1Q07084 YMR295CYMR295C 594 nt5.36□□□□□ -1.55
SSK1Q07084 MTQ1YNL063W 945 nt5.36□□□□□ -1.55
SSK1Q07084 YBL081WYBL081W 1107 nt5.36□□□□□ -1.55
SSK1Q07084 YNR040WYNR040W 771 nt5.36□□□□□ -1.55
SSK1Q07084 AIM41YOR215C 558 nt5.36□□□□□ -1.55
SSK1Q07084 RDL2YOR286W 450 nt5.36□□□□□ -1.55
SSK1Q07084 GPA2YER020W 1350 nt5.36□□□□□ -1.55
SSK1Q07084 VPS70YJR126C 2436 nt5.36□□□□□ -1.55
SSK1Q07084 MCM3YEL032W 2916 nt5.36□□□□□ -1.55
SSK1Q07084 DEF1YKL054C 2217 nt5.35□□□□□ -1.55
SSK1Q07084 WHI4YDL224C 1950 nt5.35□□□□□ -1.55
SSK1Q07084 GUA1YMR217W 1578 nt5.35□□□□□ -1.55
SSK1Q07084 YGL118CYGL118C 438 nt5.35□□□□□ -1.55
SSK1Q07084 YIR018C-AYIR018C-A 138 nt5.35□□□□□ -1.55
SSK1Q07084 YOL131WYOL131W 327 nt5.35□□□□□ -1.55
SSK1Q07084 RPN7YPR108W 1290 nt5.35□□□□□ -1.55
SSK1Q07084 GPB2YAL056W 2643 nt5.34□□□□□ -1.55
SSK1Q07084 MKK2YPL140C 1521 nt5.34□□□□□ -1.55
SSK1Q07084 HSP78YDR258C 2436 nt5.34□□□□□ -1.55
SSK1Q07084 CRF1YDR223W 1404 nt5.34□□□□□ -1.55
SSK1Q07084 YJU3YKL094W 942 nt5.34□□□□□ -1.55
SSK1Q07084 TSA1YML028W 591 nt5.34□□□□□ -1.55
SSK1Q07084 RFA2YNL312W 822 nt5.34□□□□□ -1.55
SSK1Q07084 HEM15YOR176W 1182 nt5.34□□□□□ -1.55
SSK1Q07084 CWC27YPL064C 906 nt5.34□□□□□ -1.55
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