Protein–RNA interactions for Protein: Q06666

Srst, Octapeptide-repeat protein T2, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrstQ06666 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SrstQ06666 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SrstQ06666 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SrstQ06666 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SrstQ06666 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SrstQ06666 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SrstQ06666 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SrstQ06666 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SrstQ06666 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SrstQ06666 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SrstQ06666 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SrstQ06666 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SrstQ06666 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SrstQ06666 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SrstQ06666 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SrstQ06666 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SrstQ06666 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SrstQ06666 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SrstQ06666 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SrstQ06666 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SrstQ06666 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SrstQ06666 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SrstQ06666 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SrstQ06666 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SrstQ06666 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SrstQ06666 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SrstQ06666 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SrstQ06666 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SrstQ06666 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SrstQ06666 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SrstQ06666 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SrstQ06666 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SrstQ06666 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SrstQ06666 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SrstQ06666 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SrstQ06666 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SrstQ06666 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SrstQ06666 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SrstQ06666 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SrstQ06666 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SrstQ06666 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SrstQ06666 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SrstQ06666 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SrstQ06666 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SrstQ06666 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SrstQ06666 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SrstQ06666 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SrstQ06666 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SrstQ06666 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SrstQ06666 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SrstQ06666 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SrstQ06666 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SrstQ06666 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SrstQ06666 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SrstQ06666 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SrstQ06666 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SrstQ06666 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SrstQ06666 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SrstQ06666 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SrstQ06666 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SrstQ06666 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SrstQ06666 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SrstQ06666 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SrstQ06666 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SrstQ06666 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SrstQ06666 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SrstQ06666 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SrstQ06666 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SrstQ06666 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SrstQ06666 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SrstQ06666 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SrstQ06666 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SrstQ06666 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SrstQ06666 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SrstQ06666 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SrstQ06666 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SrstQ06666 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SrstQ06666 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SrstQ06666 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SrstQ06666 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SrstQ06666 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SrstQ06666 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SrstQ06666 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SrstQ06666 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SrstQ06666 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SrstQ06666 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SrstQ06666 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SrstQ06666 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SrstQ06666 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SrstQ06666 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SrstQ06666 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SrstQ06666 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SrstQ06666 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SrstQ06666 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SrstQ06666 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SrstQ06666 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SrstQ06666 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SrstQ06666 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SrstQ06666 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SrstQ06666 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms