Protein–RNA interactions for Protein: Q02738

Gjb4, Gap junction beta-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb4Q02738 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gjb4Q02738 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Gjb4Q02738 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gjb4Q02738 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gjb4Q02738 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gjb4Q02738 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gjb4Q02738 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gjb4Q02738 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gjb4Q02738 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gjb4Q02738 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gjb4Q02738 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gjb4Q02738 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gjb4Q02738 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gjb4Q02738 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gjb4Q02738 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gjb4Q02738 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gjb4Q02738 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Gjb4Q02738 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gjb4Q02738 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gjb4Q02738 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gjb4Q02738 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gjb4Q02738 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gjb4Q02738 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gjb4Q02738 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gjb4Q02738 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gjb4Q02738 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gjb4Q02738 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gjb4Q02738 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gjb4Q02738 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gjb4Q02738 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gjb4Q02738 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gjb4Q02738 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gjb4Q02738 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gjb4Q02738 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gjb4Q02738 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gjb4Q02738 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gjb4Q02738 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gjb4Q02738 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gjb4Q02738 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gjb4Q02738 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gjb4Q02738 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gjb4Q02738 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gjb4Q02738 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gjb4Q02738 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gjb4Q02738 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gjb4Q02738 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gjb4Q02738 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gjb4Q02738 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gjb4Q02738 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gjb4Q02738 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gjb4Q02738 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gjb4Q02738 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gjb4Q02738 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Gjb4Q02738 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Gjb4Q02738 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gjb4Q02738 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gjb4Q02738 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gjb4Q02738 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gjb4Q02738 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gjb4Q02738 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gjb4Q02738 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gjb4Q02738 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gjb4Q02738 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gjb4Q02738 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gjb4Q02738 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gjb4Q02738 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gjb4Q02738 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gjb4Q02738 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Gjb4Q02738 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gjb4Q02738 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gjb4Q02738 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gjb4Q02738 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gjb4Q02738 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gjb4Q02738 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gjb4Q02738 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gjb4Q02738 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gjb4Q02738 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gjb4Q02738 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gjb4Q02738 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gjb4Q02738 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Gjb4Q02738 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gjb4Q02738 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gjb4Q02738 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gjb4Q02738 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gjb4Q02738 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gjb4Q02738 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gjb4Q02738 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gjb4Q02738 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gjb4Q02738 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gjb4Q02738 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gjb4Q02738 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gjb4Q02738 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gjb4Q02738 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gjb4Q02738 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gjb4Q02738 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gjb4Q02738 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gjb4Q02738 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gjb4Q02738 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gjb4Q02738 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gjb4Q02738 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms