Protein–RNA interactions for Protein: Q01098

Grin2c, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, mousemouse

Predictions only

Length 1,239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2cQ01098 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Grin2cQ01098 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Grin2cQ01098 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Grin2cQ01098 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Grin2cQ01098 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Grin2cQ01098 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Grin2cQ01098 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Grin2cQ01098 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Grin2cQ01098 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Grin2cQ01098 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Grin2cQ01098 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Grin2cQ01098 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Grin2cQ01098 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Grin2cQ01098 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Grin2cQ01098 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Grin2cQ01098 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Grin2cQ01098 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Grin2cQ01098 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Grin2cQ01098 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Grin2cQ01098 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Grin2cQ01098 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Grin2cQ01098 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Grin2cQ01098 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Grin2cQ01098 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Grin2cQ01098 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Grin2cQ01098 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Grin2cQ01098 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Grin2cQ01098 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Grin2cQ01098 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Grin2cQ01098 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Grin2cQ01098 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Grin2cQ01098 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Grin2cQ01098 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Grin2cQ01098 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Grin2cQ01098 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Grin2cQ01098 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Grin2cQ01098 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Grin2cQ01098 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Grin2cQ01098 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Grin2cQ01098 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Grin2cQ01098 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Grin2cQ01098 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Grin2cQ01098 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Grin2cQ01098 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Grin2cQ01098 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Grin2cQ01098 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Grin2cQ01098 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Grin2cQ01098 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Grin2cQ01098 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Grin2cQ01098 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Grin2cQ01098 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Grin2cQ01098 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Grin2cQ01098 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Grin2cQ01098 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Grin2cQ01098 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Grin2cQ01098 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Grin2cQ01098 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Grin2cQ01098 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Grin2cQ01098 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Grin2cQ01098 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Grin2cQ01098 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Grin2cQ01098 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Grin2cQ01098 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Grin2cQ01098 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Grin2cQ01098 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Grin2cQ01098 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Grin2cQ01098 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Grin2cQ01098 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Grin2cQ01098 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Grin2cQ01098 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Grin2cQ01098 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Grin2cQ01098 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Grin2cQ01098 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Grin2cQ01098 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Grin2cQ01098 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Grin2cQ01098 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Grin2cQ01098 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Grin2cQ01098 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Grin2cQ01098 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Grin2cQ01098 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Grin2cQ01098 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Grin2cQ01098 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Grin2cQ01098 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Grin2cQ01098 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Grin2cQ01098 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Grin2cQ01098 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Grin2cQ01098 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Grin2cQ01098 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Grin2cQ01098 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Grin2cQ01098 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Grin2cQ01098 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Grin2cQ01098 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Grin2cQ01098 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Grin2cQ01098 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Grin2cQ01098 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Grin2cQ01098 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Grin2cQ01098 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Grin2cQ01098 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Grin2cQ01098 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Grin2cQ01098 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.8 ms