Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gjb2Q00977 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gjb2Q00977 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gjb2Q00977 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gjb2Q00977 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gjb2Q00977 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gjb2Q00977 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gjb2Q00977 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gjb2Q00977 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gjb2Q00977 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gjb2Q00977 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Gjb2Q00977 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gjb2Q00977 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gjb2Q00977 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Gjb2Q00977 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gjb2Q00977 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gjb2Q00977 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gjb2Q00977 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gjb2Q00977 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gjb2Q00977 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gjb2Q00977 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gjb2Q00977 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gjb2Q00977 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gjb2Q00977 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Gjb2Q00977 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Gjb2Q00977 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Gjb2Q00977 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gjb2Q00977 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gjb2Q00977 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gjb2Q00977 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gjb2Q00977 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gjb2Q00977 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gjb2Q00977 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Gjb2Q00977 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gjb2Q00977 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gjb2Q00977 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gjb2Q00977 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gjb2Q00977 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gjb2Q00977 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gjb2Q00977 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gjb2Q00977 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gjb2Q00977 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gjb2Q00977 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gjb2Q00977 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gjb2Q00977 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gjb2Q00977 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gjb2Q00977 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gjb2Q00977 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gjb2Q00977 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gjb2Q00977 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gjb2Q00977 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gjb2Q00977 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gjb2Q00977 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gjb2Q00977 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gjb2Q00977 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gjb2Q00977 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gjb2Q00977 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gjb2Q00977 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gjb2Q00977 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gjb2Q00977 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Gjb2Q00977 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Gjb2Q00977 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gjb2Q00977 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Gjb2Q00977 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gjb2Q00977 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gjb2Q00977 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gjb2Q00977 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Gjb2Q00977 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Gjb2Q00977 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
Gjb2Q00977 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gjb2Q00977 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gjb2Q00977 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gjb2Q00977 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gjb2Q00977 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gjb2Q00977 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gjb2Q00977 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gjb2Q00977 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Gjb2Q00977 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gjb2Q00977 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gjb2Q00977 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gjb2Q00977 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gjb2Q00977 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gjb2Q00977 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gjb2Q00977 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gjb2Q00977 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gjb2Q00977 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gjb2Q00977 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gjb2Q00977 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gjb2Q00977 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gjb2Q00977 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gjb2Q00977 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Gjb2Q00977 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gjb2Q00977 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gjb2Q00977 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gjb2Q00977 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gjb2Q00977 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gjb2Q00977 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Gjb2Q00977 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gjb2Q00977 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gjb2Q00977 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms