Protein–RNA interactions for Protein: Q00724

Rbp4, Retinol-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp4Q00724 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rbp4Q00724 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rbp4Q00724 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rbp4Q00724 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rbp4Q00724 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Rbp4Q00724 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Rbp4Q00724 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Rbp4Q00724 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rbp4Q00724 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rbp4Q00724 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rbp4Q00724 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rbp4Q00724 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rbp4Q00724 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rbp4Q00724 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rbp4Q00724 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Rbp4Q00724 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rbp4Q00724 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rbp4Q00724 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rbp4Q00724 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rbp4Q00724 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rbp4Q00724 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rbp4Q00724 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rbp4Q00724 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rbp4Q00724 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rbp4Q00724 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Rbp4Q00724 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rbp4Q00724 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rbp4Q00724 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rbp4Q00724 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rbp4Q00724 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rbp4Q00724 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rbp4Q00724 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rbp4Q00724 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rbp4Q00724 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rbp4Q00724 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rbp4Q00724 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rbp4Q00724 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rbp4Q00724 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Rbp4Q00724 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rbp4Q00724 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rbp4Q00724 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rbp4Q00724 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rbp4Q00724 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rbp4Q00724 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rbp4Q00724 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rbp4Q00724 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rbp4Q00724 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rbp4Q00724 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rbp4Q00724 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rbp4Q00724 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rbp4Q00724 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rbp4Q00724 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rbp4Q00724 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rbp4Q00724 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rbp4Q00724 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Rbp4Q00724 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rbp4Q00724 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rbp4Q00724 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rbp4Q00724 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rbp4Q00724 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rbp4Q00724 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rbp4Q00724 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rbp4Q00724 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rbp4Q00724 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rbp4Q00724 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rbp4Q00724 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rbp4Q00724 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rbp4Q00724 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rbp4Q00724 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rbp4Q00724 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rbp4Q00724 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rbp4Q00724 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rbp4Q00724 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rbp4Q00724 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rbp4Q00724 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Rbp4Q00724 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Rbp4Q00724 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rbp4Q00724 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rbp4Q00724 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rbp4Q00724 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rbp4Q00724 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rbp4Q00724 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rbp4Q00724 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rbp4Q00724 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rbp4Q00724 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rbp4Q00724 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rbp4Q00724 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rbp4Q00724 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rbp4Q00724 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rbp4Q00724 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Rbp4Q00724 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rbp4Q00724 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rbp4Q00724 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rbp4Q00724 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rbp4Q00724 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rbp4Q00724 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rbp4Q00724 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rbp4Q00724 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Rbp4Q00724 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rbp4Q00724 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.1 ms