Protein–RNA interactions for Protein: P97927

Lama4, Laminin subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,816 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lama4P97927 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Lama4P97927 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Lama4P97927 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Lama4P97927 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Lama4P97927 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Lama4P97927 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Lama4P97927 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Lama4P97927 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Lama4P97927 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Lama4P97927 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Lama4P97927 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Lama4P97927 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Lama4P97927 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Lama4P97927 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Lama4P97927 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Lama4P97927 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Lama4P97927 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Lama4P97927 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Lama4P97927 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Lama4P97927 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Lama4P97927 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Lama4P97927 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Lama4P97927 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Lama4P97927 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Lama4P97927 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Lama4P97927 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Lama4P97927 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Lama4P97927 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Lama4P97927 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Lama4P97927 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Lama4P97927 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Lama4P97927 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Lama4P97927 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Lama4P97927 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Lama4P97927 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Lama4P97927 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Lama4P97927 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Lama4P97927 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Lama4P97927 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Lama4P97927 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Lama4P97927 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Lama4P97927 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Lama4P97927 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Lama4P97927 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Lama4P97927 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Lama4P97927 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Lama4P97927 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Lama4P97927 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC26.76■■□□□ 1.88
Lama4P97927 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Lama4P97927 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Lama4P97927 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Lama4P97927 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Lama4P97927 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Lama4P97927 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Lama4P97927 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Lama4P97927 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Lama4P97927 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Lama4P97927 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Lama4P97927 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Lama4P97927 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Lama4P97927 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Lama4P97927 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Lama4P97927 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Lama4P97927 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Lama4P97927 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Lama4P97927 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Lama4P97927 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Lama4P97927 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Lama4P97927 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Lama4P97927 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Lama4P97927 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Lama4P97927 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Lama4P97927 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Lama4P97927 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
Lama4P97927 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
Lama4P97927 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Lama4P97927 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Lama4P97927 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Lama4P97927 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Lama4P97927 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Lama4P97927 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Lama4P97927 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Lama4P97927 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Lama4P97927 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Lama4P97927 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Lama4P97927 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Lama4P97927 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Lama4P97927 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Lama4P97927 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Lama4P97927 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Lama4P97927 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Lama4P97927 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Lama4P97927 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Lama4P97927 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Lama4P97927 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Lama4P97927 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Lama4P97927 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Lama4P97927 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Lama4P97927 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Lama4P97927 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms