Protein–RNA interactions for Protein: P97817

Cdr2, Cerebellar degeneration-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdr2P97817 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdr2P97817 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdr2P97817 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdr2P97817 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdr2P97817 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdr2P97817 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdr2P97817 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdr2P97817 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdr2P97817 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdr2P97817 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdr2P97817 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdr2P97817 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdr2P97817 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdr2P97817 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdr2P97817 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdr2P97817 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdr2P97817 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdr2P97817 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdr2P97817 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdr2P97817 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdr2P97817 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdr2P97817 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdr2P97817 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdr2P97817 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdr2P97817 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdr2P97817 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdr2P97817 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdr2P97817 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdr2P97817 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdr2P97817 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdr2P97817 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdr2P97817 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdr2P97817 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdr2P97817 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdr2P97817 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdr2P97817 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdr2P97817 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdr2P97817 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdr2P97817 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdr2P97817 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdr2P97817 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdr2P97817 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdr2P97817 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdr2P97817 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdr2P97817 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdr2P97817 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdr2P97817 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdr2P97817 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdr2P97817 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdr2P97817 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdr2P97817 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdr2P97817 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdr2P97817 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdr2P97817 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdr2P97817 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdr2P97817 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cdr2P97817 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cdr2P97817 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cdr2P97817 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cdr2P97817 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cdr2P97817 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cdr2P97817 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cdr2P97817 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cdr2P97817 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cdr2P97817 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cdr2P97817 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cdr2P97817 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cdr2P97817 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cdr2P97817 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cdr2P97817 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cdr2P97817 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cdr2P97817 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cdr2P97817 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cdr2P97817 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cdr2P97817 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cdr2P97817 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cdr2P97817 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cdr2P97817 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cdr2P97817 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cdr2P97817 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cdr2P97817 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cdr2P97817 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cdr2P97817 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cdr2P97817 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cdr2P97817 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cdr2P97817 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cdr2P97817 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Cdr2P97817 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cdr2P97817 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cdr2P97817 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cdr2P97817 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cdr2P97817 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cdr2P97817 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cdr2P97817 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cdr2P97817 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Cdr2P97817 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cdr2P97817 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cdr2P97817 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cdr2P97817 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cdr2P97817 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms