Protein–RNA interactions for Protein: P97386

Lig3, DNA ligase 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,015 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig3P97386 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lig3P97386 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lig3P97386 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lig3P97386 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lig3P97386 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lig3P97386 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lig3P97386 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lig3P97386 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lig3P97386 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lig3P97386 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Lig3P97386 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lig3P97386 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lig3P97386 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lig3P97386 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lig3P97386 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lig3P97386 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lig3P97386 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lig3P97386 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lig3P97386 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lig3P97386 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lig3P97386 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lig3P97386 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lig3P97386 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lig3P97386 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lig3P97386 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lig3P97386 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lig3P97386 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lig3P97386 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lig3P97386 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lig3P97386 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lig3P97386 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lig3P97386 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lig3P97386 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lig3P97386 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lig3P97386 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lig3P97386 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lig3P97386 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lig3P97386 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lig3P97386 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lig3P97386 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lig3P97386 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lig3P97386 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lig3P97386 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Lig3P97386 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lig3P97386 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lig3P97386 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lig3P97386 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Lig3P97386 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Lig3P97386 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lig3P97386 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lig3P97386 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lig3P97386 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lig3P97386 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lig3P97386 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lig3P97386 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lig3P97386 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lig3P97386 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lig3P97386 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lig3P97386 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lig3P97386 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lig3P97386 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lig3P97386 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lig3P97386 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lig3P97386 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Lig3P97386 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lig3P97386 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lig3P97386 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lig3P97386 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Lig3P97386 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lig3P97386 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lig3P97386 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lig3P97386 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lig3P97386 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Lig3P97386 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lig3P97386 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lig3P97386 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lig3P97386 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lig3P97386 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lig3P97386 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lig3P97386 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lig3P97386 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Lig3P97386 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Lig3P97386 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lig3P97386 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lig3P97386 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lig3P97386 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Lig3P97386 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lig3P97386 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lig3P97386 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lig3P97386 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Lig3P97386 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lig3P97386 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lig3P97386 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lig3P97386 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.27
Lig3P97386 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Lig3P97386 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lig3P97386 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lig3P97386 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lig3P97386 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lig3P97386 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms