Protein–RNA interactions for Protein: P97334

Nkx2-3, Homeobox protein Nkx-2.3, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx2-3P97334 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Nkx2-3P97334 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Nkx2-3P97334 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Nkx2-3P97334 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Nkx2-3P97334 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Nkx2-3P97334 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Nkx2-3P97334 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Nkx2-3P97334 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Nkx2-3P97334 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Nkx2-3P97334 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Nkx2-3P97334 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Nkx2-3P97334 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Nkx2-3P97334 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Nkx2-3P97334 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Nkx2-3P97334 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Nkx2-3P97334 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Nkx2-3P97334 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Nkx2-3P97334 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Nkx2-3P97334 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Nkx2-3P97334 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Nkx2-3P97334 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Nkx2-3P97334 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Nkx2-3P97334 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Nkx2-3P97334 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Nkx2-3P97334 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Nkx2-3P97334 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Nkx2-3P97334 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Nkx2-3P97334 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Nkx2-3P97334 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Nkx2-3P97334 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Nkx2-3P97334 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Nkx2-3P97334 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Nkx2-3P97334 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Nkx2-3P97334 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Nkx2-3P97334 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Nkx2-3P97334 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Nkx2-3P97334 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Nkx2-3P97334 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Nkx2-3P97334 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Nkx2-3P97334 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Nkx2-3P97334 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Nkx2-3P97334 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Nkx2-3P97334 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Nkx2-3P97334 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Nkx2-3P97334 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Nkx2-3P97334 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
Nkx2-3P97334 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Nkx2-3P97334 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Nkx2-3P97334 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Nkx2-3P97334 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Nkx2-3P97334 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Nkx2-3P97334 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
Nkx2-3P97334 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Nkx2-3P97334 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Nkx2-3P97334 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Nkx2-3P97334 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Nkx2-3P97334 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Nkx2-3P97334 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Nkx2-3P97334 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Nkx2-3P97334 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Nkx2-3P97334 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Nkx2-3P97334 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Nkx2-3P97334 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Nkx2-3P97334 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Nkx2-3P97334 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Nkx2-3P97334 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Nkx2-3P97334 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Nkx2-3P97334 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Nkx2-3P97334 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Nkx2-3P97334 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Nkx2-3P97334 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Nkx2-3P97334 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Nkx2-3P97334 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Nkx2-3P97334 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Nkx2-3P97334 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Nkx2-3P97334 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Nkx2-3P97334 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Nkx2-3P97334 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Nkx2-3P97334 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Nkx2-3P97334 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Nkx2-3P97334 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Nkx2-3P97334 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Nkx2-3P97334 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Nkx2-3P97334 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Nkx2-3P97334 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Nkx2-3P97334 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Nkx2-3P97334 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
Nkx2-3P97334 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Nkx2-3P97334 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Nkx2-3P97334 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Nkx2-3P97334 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Nkx2-3P97334 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Nkx2-3P97334 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Nkx2-3P97334 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Nkx2-3P97334 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Nkx2-3P97334 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Nkx2-3P97334 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Nkx2-3P97334 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Nkx2-3P97334 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Nkx2-3P97334 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms