Protein–RNA interactions for Protein: P70704

Atp8a1, Phospholipid-transporting ATPase IA, mousemouse

Predictions only

Length 1,164 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8a1P70704 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atp8a1P70704 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atp8a1P70704 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atp8a1P70704 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atp8a1P70704 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atp8a1P70704 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atp8a1P70704 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atp8a1P70704 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atp8a1P70704 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atp8a1P70704 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Atp8a1P70704 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Atp8a1P70704 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atp8a1P70704 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atp8a1P70704 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atp8a1P70704 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Atp8a1P70704 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Atp8a1P70704 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atp8a1P70704 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atp8a1P70704 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Atp8a1P70704 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atp8a1P70704 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atp8a1P70704 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Atp8a1P70704 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atp8a1P70704 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Atp8a1P70704 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atp8a1P70704 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atp8a1P70704 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atp8a1P70704 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atp8a1P70704 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atp8a1P70704 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atp8a1P70704 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atp8a1P70704 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atp8a1P70704 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atp8a1P70704 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atp8a1P70704 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atp8a1P70704 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atp8a1P70704 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atp8a1P70704 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atp8a1P70704 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atp8a1P70704 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atp8a1P70704 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atp8a1P70704 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atp8a1P70704 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp8a1P70704 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp8a1P70704 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp8a1P70704 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp8a1P70704 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp8a1P70704 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atp8a1P70704 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atp8a1P70704 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atp8a1P70704 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atp8a1P70704 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atp8a1P70704 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atp8a1P70704 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atp8a1P70704 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atp8a1P70704 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atp8a1P70704 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atp8a1P70704 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Atp8a1P70704 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atp8a1P70704 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atp8a1P70704 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atp8a1P70704 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atp8a1P70704 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atp8a1P70704 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atp8a1P70704 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atp8a1P70704 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atp8a1P70704 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atp8a1P70704 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atp8a1P70704 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atp8a1P70704 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atp8a1P70704 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atp8a1P70704 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atp8a1P70704 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atp8a1P70704 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atp8a1P70704 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Atp8a1P70704 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atp8a1P70704 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atp8a1P70704 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atp8a1P70704 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atp8a1P70704 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atp8a1P70704 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atp8a1P70704 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atp8a1P70704 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp8a1P70704 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp8a1P70704 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp8a1P70704 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp8a1P70704 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp8a1P70704 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp8a1P70704 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp8a1P70704 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp8a1P70704 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp8a1P70704 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp8a1P70704 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp8a1P70704 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp8a1P70704 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp8a1P70704 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp8a1P70704 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp8a1P70704 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp8a1P70704 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp8a1P70704 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms