Protein–RNA interactions for Protein: P63024

Vamp3, Vesicle-associated membrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp3P63024 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vamp3P63024 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vamp3P63024 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vamp3P63024 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vamp3P63024 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vamp3P63024 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Vamp3P63024 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Vamp3P63024 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vamp3P63024 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vamp3P63024 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vamp3P63024 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vamp3P63024 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vamp3P63024 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vamp3P63024 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vamp3P63024 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vamp3P63024 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vamp3P63024 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vamp3P63024 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Vamp3P63024 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Vamp3P63024 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vamp3P63024 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vamp3P63024 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vamp3P63024 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vamp3P63024 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Vamp3P63024 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vamp3P63024 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vamp3P63024 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vamp3P63024 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vamp3P63024 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vamp3P63024 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vamp3P63024 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vamp3P63024 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vamp3P63024 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vamp3P63024 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vamp3P63024 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vamp3P63024 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vamp3P63024 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vamp3P63024 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vamp3P63024 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vamp3P63024 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vamp3P63024 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vamp3P63024 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vamp3P63024 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vamp3P63024 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vamp3P63024 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Vamp3P63024 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vamp3P63024 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vamp3P63024 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vamp3P63024 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vamp3P63024 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vamp3P63024 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Vamp3P63024 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vamp3P63024 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vamp3P63024 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vamp3P63024 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vamp3P63024 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vamp3P63024 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vamp3P63024 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vamp3P63024 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vamp3P63024 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vamp3P63024 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vamp3P63024 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vamp3P63024 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vamp3P63024 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vamp3P63024 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vamp3P63024 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vamp3P63024 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vamp3P63024 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Vamp3P63024 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vamp3P63024 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vamp3P63024 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vamp3P63024 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vamp3P63024 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vamp3P63024 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vamp3P63024 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vamp3P63024 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vamp3P63024 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vamp3P63024 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vamp3P63024 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vamp3P63024 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vamp3P63024 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vamp3P63024 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vamp3P63024 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vamp3P63024 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vamp3P63024 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vamp3P63024 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vamp3P63024 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vamp3P63024 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vamp3P63024 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vamp3P63024 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vamp3P63024 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vamp3P63024 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vamp3P63024 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vamp3P63024 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vamp3P63024 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vamp3P63024 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vamp3P63024 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vamp3P63024 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vamp3P63024 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Vamp3P63024 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms