Protein–RNA interactions for Protein: P62743

Ap2s1, AP-2 complex subunit sigma, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap2s1P62743 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ap2s1P62743 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ap2s1P62743 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ap2s1P62743 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ap2s1P62743 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ap2s1P62743 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ap2s1P62743 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ap2s1P62743 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ap2s1P62743 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ap2s1P62743 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ap2s1P62743 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ap2s1P62743 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ap2s1P62743 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ap2s1P62743 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ap2s1P62743 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ap2s1P62743 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ap2s1P62743 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ap2s1P62743 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ap2s1P62743 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ap2s1P62743 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ap2s1P62743 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ap2s1P62743 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ap2s1P62743 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Ap2s1P62743 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ap2s1P62743 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ap2s1P62743 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ap2s1P62743 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ap2s1P62743 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ap2s1P62743 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ap2s1P62743 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ap2s1P62743 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ap2s1P62743 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ap2s1P62743 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ap2s1P62743 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ap2s1P62743 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ap2s1P62743 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ap2s1P62743 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ap2s1P62743 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ap2s1P62743 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Ap2s1P62743 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ap2s1P62743 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ap2s1P62743 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ap2s1P62743 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ap2s1P62743 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ap2s1P62743 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ap2s1P62743 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ap2s1P62743 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ap2s1P62743 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ap2s1P62743 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ap2s1P62743 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ap2s1P62743 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ap2s1P62743 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ap2s1P62743 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ap2s1P62743 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ap2s1P62743 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ap2s1P62743 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ap2s1P62743 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ap2s1P62743 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ap2s1P62743 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ap2s1P62743 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ap2s1P62743 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ap2s1P62743 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ap2s1P62743 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ap2s1P62743 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ap2s1P62743 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ap2s1P62743 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ap2s1P62743 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ap2s1P62743 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ap2s1P62743 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ap2s1P62743 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ap2s1P62743 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ap2s1P62743 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ap2s1P62743 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ap2s1P62743 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ap2s1P62743 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ap2s1P62743 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ap2s1P62743 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ap2s1P62743 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ap2s1P62743 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ap2s1P62743 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ap2s1P62743 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ap2s1P62743 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ap2s1P62743 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ap2s1P62743 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ap2s1P62743 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ap2s1P62743 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ap2s1P62743 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ap2s1P62743 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ap2s1P62743 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ap2s1P62743 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ap2s1P62743 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ap2s1P62743 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ap2s1P62743 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ap2s1P62743 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ap2s1P62743 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ap2s1P62743 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ap2s1P62743 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ap2s1P62743 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ap2s1P62743 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ap2s1P62743 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms