Protein–RNA interactions for Protein: P62080

Tspan5, Tetraspanin-5, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan5P62080 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tspan5P62080 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tspan5P62080 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tspan5P62080 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tspan5P62080 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tspan5P62080 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tspan5P62080 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tspan5P62080 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tspan5P62080 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tspan5P62080 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tspan5P62080 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tspan5P62080 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tspan5P62080 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tspan5P62080 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tspan5P62080 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tspan5P62080 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tspan5P62080 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tspan5P62080 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tspan5P62080 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tspan5P62080 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tspan5P62080 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tspan5P62080 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tspan5P62080 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tspan5P62080 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tspan5P62080 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tspan5P62080 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tspan5P62080 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tspan5P62080 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tspan5P62080 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Tspan5P62080 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tspan5P62080 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tspan5P62080 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tspan5P62080 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tspan5P62080 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tspan5P62080 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tspan5P62080 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tspan5P62080 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tspan5P62080 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tspan5P62080 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tspan5P62080 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tspan5P62080 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tspan5P62080 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Tspan5P62080 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tspan5P62080 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tspan5P62080 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Tspan5P62080 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tspan5P62080 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tspan5P62080 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tspan5P62080 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tspan5P62080 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tspan5P62080 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tspan5P62080 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tspan5P62080 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tspan5P62080 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tspan5P62080 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tspan5P62080 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tspan5P62080 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tspan5P62080 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tspan5P62080 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tspan5P62080 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tspan5P62080 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tspan5P62080 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tspan5P62080 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tspan5P62080 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Tspan5P62080 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Tspan5P62080 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tspan5P62080 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tspan5P62080 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tspan5P62080 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tspan5P62080 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tspan5P62080 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tspan5P62080 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tspan5P62080 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tspan5P62080 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tspan5P62080 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tspan5P62080 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tspan5P62080 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tspan5P62080 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Tspan5P62080 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tspan5P62080 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tspan5P62080 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tspan5P62080 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tspan5P62080 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tspan5P62080 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tspan5P62080 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tspan5P62080 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tspan5P62080 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tspan5P62080 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tspan5P62080 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tspan5P62080 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Tspan5P62080 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tspan5P62080 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tspan5P62080 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tspan5P62080 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tspan5P62080 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tspan5P62080 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tspan5P62080 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tspan5P62080 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tspan5P62080 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tspan5P62080 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms