Protein–RNA interactions for Protein: P61460

Depdc5, GATOR complex protein DEPDC5, mousemouse

Predictions only

Length 1,591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Depdc5P61460 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Depdc5P61460 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Depdc5P61460 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Depdc5P61460 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
Depdc5P61460 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Depdc5P61460 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
Depdc5P61460 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
Depdc5P61460 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Depdc5P61460 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Depdc5P61460 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Depdc5P61460 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Depdc5P61460 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC32.9■■■□□ 2.86
Depdc5P61460 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Depdc5P61460 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
Depdc5P61460 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC32.89■■■□□ 2.86
Depdc5P61460 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
Depdc5P61460 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Depdc5P61460 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Depdc5P61460 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Depdc5P61460 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.85
Depdc5P61460 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
Depdc5P61460 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
Depdc5P61460 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Depdc5P61460 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Depdc5P61460 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Depdc5P61460 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Depdc5P61460 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Depdc5P61460 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Depdc5P61460 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Depdc5P61460 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Depdc5P61460 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Depdc5P61460 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Depdc5P61460 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Depdc5P61460 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Depdc5P61460 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Depdc5P61460 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Depdc5P61460 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Depdc5P61460 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Depdc5P61460 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
Depdc5P61460 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Depdc5P61460 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Depdc5P61460 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Depdc5P61460 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Depdc5P61460 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC32.81■■■□□ 2.84
Depdc5P61460 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Depdc5P61460 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
Depdc5P61460 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Depdc5P61460 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Depdc5P61460 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
Depdc5P61460 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Depdc5P61460 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Depdc5P61460 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC32.78■■■□□ 2.84
Depdc5P61460 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Depdc5P61460 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Depdc5P61460 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Depdc5P61460 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Depdc5P61460 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Depdc5P61460 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Depdc5P61460 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
Depdc5P61460 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC32.77■■■□□ 2.84
Depdc5P61460 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
Depdc5P61460 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Depdc5P61460 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.84
Depdc5P61460 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC32.76■■■□□ 2.84
Depdc5P61460 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Depdc5P61460 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Depdc5P61460 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
Depdc5P61460 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
Depdc5P61460 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.75■■■□□ 2.83
Depdc5P61460 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Depdc5P61460 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
Depdc5P61460 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
Depdc5P61460 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Depdc5P61460 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Depdc5P61460 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
Depdc5P61460 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Depdc5P61460 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
Depdc5P61460 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Depdc5P61460 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Depdc5P61460 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Depdc5P61460 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
Depdc5P61460 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Depdc5P61460 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC32.7■■■□□ 2.83
Depdc5P61460 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Depdc5P61460 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
Depdc5P61460 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC32.69■■■□□ 2.82
Depdc5P61460 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
Depdc5P61460 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Depdc5P61460 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.69■■■□□ 2.82
Depdc5P61460 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Depdc5P61460 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Depdc5P61460 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Depdc5P61460 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Depdc5P61460 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC32.68■■■□□ 2.82
Depdc5P61460 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Depdc5P61460 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Depdc5P61460 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Depdc5P61460 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Depdc5P61460 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Depdc5P61460 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.7 ms