Protein–RNA interactions for Protein: P58801

Ripk2, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 2, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ripk2P58801 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ripk2P58801 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Ripk2P58801 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ripk2P58801 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ripk2P58801 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ripk2P58801 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ripk2P58801 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ripk2P58801 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ripk2P58801 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ripk2P58801 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ripk2P58801 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ripk2P58801 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ripk2P58801 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ripk2P58801 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ripk2P58801 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ripk2P58801 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ripk2P58801 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ripk2P58801 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ripk2P58801 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ripk2P58801 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ripk2P58801 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ripk2P58801 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ripk2P58801 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ripk2P58801 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ripk2P58801 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ripk2P58801 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ripk2P58801 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ripk2P58801 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ripk2P58801 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ripk2P58801 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ripk2P58801 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ripk2P58801 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ripk2P58801 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ripk2P58801 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ripk2P58801 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ripk2P58801 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ripk2P58801 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ripk2P58801 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ripk2P58801 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ripk2P58801 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ripk2P58801 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ripk2P58801 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ripk2P58801 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ripk2P58801 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ripk2P58801 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ripk2P58801 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ripk2P58801 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ripk2P58801 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ripk2P58801 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ripk2P58801 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ripk2P58801 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ripk2P58801 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ripk2P58801 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ripk2P58801 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ripk2P58801 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ripk2P58801 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ripk2P58801 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ripk2P58801 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ripk2P58801 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ripk2P58801 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ripk2P58801 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ripk2P58801 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ripk2P58801 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ripk2P58801 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ripk2P58801 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ripk2P58801 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ripk2P58801 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ripk2P58801 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ripk2P58801 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Ripk2P58801 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ripk2P58801 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ripk2P58801 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ripk2P58801 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ripk2P58801 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ripk2P58801 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ripk2P58801 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ripk2P58801 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ripk2P58801 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ripk2P58801 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ripk2P58801 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ripk2P58801 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ripk2P58801 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ripk2P58801 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ripk2P58801 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ripk2P58801 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ripk2P58801 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ripk2P58801 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ripk2P58801 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ripk2P58801 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ripk2P58801 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ripk2P58801 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ripk2P58801 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ripk2P58801 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ripk2P58801 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ripk2P58801 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ripk2P58801 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ripk2P58801 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ripk2P58801 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ripk2P58801 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ripk2P58801 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms