Protein–RNA interactions for Protein: P58242

Smpdl3b, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3b, mousemouse

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpdl3bP58242 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Smpdl3bP58242 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Smpdl3bP58242 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Smpdl3bP58242 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Smpdl3bP58242 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Smpdl3bP58242 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Smpdl3bP58242 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Smpdl3bP58242 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Smpdl3bP58242 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Smpdl3bP58242 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Smpdl3bP58242 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Smpdl3bP58242 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Smpdl3bP58242 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Smpdl3bP58242 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Smpdl3bP58242 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Smpdl3bP58242 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Smpdl3bP58242 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Smpdl3bP58242 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Smpdl3bP58242 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Smpdl3bP58242 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Smpdl3bP58242 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Smpdl3bP58242 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Smpdl3bP58242 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Smpdl3bP58242 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Smpdl3bP58242 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Smpdl3bP58242 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Smpdl3bP58242 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Smpdl3bP58242 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Smpdl3bP58242 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Smpdl3bP58242 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Smpdl3bP58242 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Smpdl3bP58242 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Smpdl3bP58242 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Smpdl3bP58242 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Smpdl3bP58242 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Smpdl3bP58242 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Smpdl3bP58242 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Smpdl3bP58242 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Smpdl3bP58242 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Smpdl3bP58242 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Smpdl3bP58242 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Smpdl3bP58242 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Smpdl3bP58242 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Smpdl3bP58242 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Smpdl3bP58242 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Smpdl3bP58242 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Smpdl3bP58242 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Smpdl3bP58242 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Smpdl3bP58242 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Smpdl3bP58242 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Smpdl3bP58242 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Smpdl3bP58242 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Smpdl3bP58242 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Smpdl3bP58242 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Smpdl3bP58242 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Smpdl3bP58242 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Smpdl3bP58242 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Smpdl3bP58242 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Smpdl3bP58242 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Smpdl3bP58242 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Smpdl3bP58242 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Smpdl3bP58242 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Smpdl3bP58242 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Smpdl3bP58242 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Smpdl3bP58242 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Smpdl3bP58242 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Smpdl3bP58242 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Smpdl3bP58242 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Smpdl3bP58242 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Smpdl3bP58242 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Smpdl3bP58242 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Smpdl3bP58242 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Smpdl3bP58242 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Smpdl3bP58242 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Smpdl3bP58242 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Smpdl3bP58242 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Smpdl3bP58242 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Smpdl3bP58242 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Smpdl3bP58242 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Smpdl3bP58242 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Smpdl3bP58242 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Smpdl3bP58242 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Smpdl3bP58242 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Smpdl3bP58242 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Smpdl3bP58242 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Smpdl3bP58242 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Smpdl3bP58242 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Smpdl3bP58242 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Smpdl3bP58242 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Smpdl3bP58242 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Smpdl3bP58242 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Smpdl3bP58242 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Smpdl3bP58242 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Smpdl3bP58242 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Smpdl3bP58242 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Smpdl3bP58242 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Smpdl3bP58242 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Smpdl3bP58242 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Smpdl3bP58242 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Smpdl3bP58242 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms