Protein–RNA interactions for Protein: P54726

Rad23a, UV excision repair protein RAD23 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23aP54726 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Rad23aP54726 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rad23aP54726 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rad23aP54726 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rad23aP54726 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rad23aP54726 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rad23aP54726 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rad23aP54726 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rad23aP54726 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rad23aP54726 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rad23aP54726 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rad23aP54726 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rad23aP54726 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rad23aP54726 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rad23aP54726 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rad23aP54726 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rad23aP54726 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rad23aP54726 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rad23aP54726 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rad23aP54726 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rad23aP54726 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rad23aP54726 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rad23aP54726 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rad23aP54726 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rad23aP54726 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rad23aP54726 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rad23aP54726 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rad23aP54726 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rad23aP54726 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rad23aP54726 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rad23aP54726 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rad23aP54726 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rad23aP54726 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rad23aP54726 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rad23aP54726 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rad23aP54726 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rad23aP54726 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rad23aP54726 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rad23aP54726 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rad23aP54726 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rad23aP54726 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rad23aP54726 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rad23aP54726 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rad23aP54726 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rad23aP54726 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rad23aP54726 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rad23aP54726 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rad23aP54726 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Rad23aP54726 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rad23aP54726 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Rad23aP54726 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rad23aP54726 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Rad23aP54726 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rad23aP54726 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rad23aP54726 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rad23aP54726 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rad23aP54726 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rad23aP54726 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rad23aP54726 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rad23aP54726 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rad23aP54726 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Rad23aP54726 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rad23aP54726 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rad23aP54726 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rad23aP54726 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rad23aP54726 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rad23aP54726 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rad23aP54726 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rad23aP54726 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rad23aP54726 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rad23aP54726 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rad23aP54726 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rad23aP54726 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rad23aP54726 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rad23aP54726 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rad23aP54726 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rad23aP54726 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rad23aP54726 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rad23aP54726 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rad23aP54726 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rad23aP54726 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rad23aP54726 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rad23aP54726 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rad23aP54726 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rad23aP54726 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rad23aP54726 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rad23aP54726 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rad23aP54726 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rad23aP54726 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rad23aP54726 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rad23aP54726 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rad23aP54726 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rad23aP54726 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rad23aP54726 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rad23aP54726 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rad23aP54726 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rad23aP54726 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rad23aP54726 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rad23aP54726 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rad23aP54726 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms