Protein–RNA interactions for Protein: P49764

Pgf, Placenta growth factor, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PgfP49764 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PgfP49764 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PgfP49764 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PgfP49764 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PgfP49764 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PgfP49764 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PgfP49764 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PgfP49764 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PgfP49764 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PgfP49764 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PgfP49764 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PgfP49764 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PgfP49764 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PgfP49764 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PgfP49764 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PgfP49764 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PgfP49764 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PgfP49764 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PgfP49764 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PgfP49764 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PgfP49764 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PgfP49764 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PgfP49764 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PgfP49764 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PgfP49764 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PgfP49764 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PgfP49764 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PgfP49764 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PgfP49764 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PgfP49764 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PgfP49764 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PgfP49764 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PgfP49764 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PgfP49764 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PgfP49764 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PgfP49764 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PgfP49764 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PgfP49764 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PgfP49764 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PgfP49764 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PgfP49764 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PgfP49764 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PgfP49764 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PgfP49764 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PgfP49764 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PgfP49764 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PgfP49764 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PgfP49764 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PgfP49764 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PgfP49764 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PgfP49764 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PgfP49764 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PgfP49764 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PgfP49764 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PgfP49764 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PgfP49764 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PgfP49764 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PgfP49764 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PgfP49764 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PgfP49764 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PgfP49764 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PgfP49764 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PgfP49764 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PgfP49764 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PgfP49764 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PgfP49764 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PgfP49764 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PgfP49764 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PgfP49764 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PgfP49764 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PgfP49764 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PgfP49764 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PgfP49764 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PgfP49764 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PgfP49764 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PgfP49764 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PgfP49764 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PgfP49764 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PgfP49764 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PgfP49764 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PgfP49764 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PgfP49764 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PgfP49764 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PgfP49764 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PgfP49764 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PgfP49764 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PgfP49764 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PgfP49764 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PgfP49764 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PgfP49764 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PgfP49764 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PgfP49764 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PgfP49764 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PgfP49764 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PgfP49764 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PgfP49764 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PgfP49764 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PgfP49764 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PgfP49764 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PgfP49764 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms