Protein–RNA interactions for Protein: P48298

Ccl11, Eotaxin, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl11P48298 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccl11P48298 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccl11P48298 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccl11P48298 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccl11P48298 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccl11P48298 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccl11P48298 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccl11P48298 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccl11P48298 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccl11P48298 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccl11P48298 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccl11P48298 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccl11P48298 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccl11P48298 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccl11P48298 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccl11P48298 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccl11P48298 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccl11P48298 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccl11P48298 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccl11P48298 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccl11P48298 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccl11P48298 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccl11P48298 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccl11P48298 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccl11P48298 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccl11P48298 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccl11P48298 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccl11P48298 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccl11P48298 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccl11P48298 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccl11P48298 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccl11P48298 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccl11P48298 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccl11P48298 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccl11P48298 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccl11P48298 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccl11P48298 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccl11P48298 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccl11P48298 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccl11P48298 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccl11P48298 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccl11P48298 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccl11P48298 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccl11P48298 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccl11P48298 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccl11P48298 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccl11P48298 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccl11P48298 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccl11P48298 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccl11P48298 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccl11P48298 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccl11P48298 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccl11P48298 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccl11P48298 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccl11P48298 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ccl11P48298 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ccl11P48298 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccl11P48298 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccl11P48298 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccl11P48298 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccl11P48298 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccl11P48298 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccl11P48298 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccl11P48298 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccl11P48298 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccl11P48298 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccl11P48298 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccl11P48298 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccl11P48298 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccl11P48298 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccl11P48298 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccl11P48298 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccl11P48298 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccl11P48298 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccl11P48298 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccl11P48298 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccl11P48298 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccl11P48298 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccl11P48298 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccl11P48298 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccl11P48298 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccl11P48298 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccl11P48298 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccl11P48298 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccl11P48298 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccl11P48298 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccl11P48298 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccl11P48298 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccl11P48298 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccl11P48298 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccl11P48298 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccl11P48298 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccl11P48298 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccl11P48298 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccl11P48298 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccl11P48298 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccl11P48298 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccl11P48298 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccl11P48298 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccl11P48298 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms