Protein–RNA interactions for Protein: P43407

Sdc2, Syndecan-2, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc2P43407 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sdc2P43407 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sdc2P43407 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sdc2P43407 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sdc2P43407 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sdc2P43407 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sdc2P43407 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sdc2P43407 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sdc2P43407 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sdc2P43407 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Sdc2P43407 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sdc2P43407 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sdc2P43407 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sdc2P43407 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sdc2P43407 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sdc2P43407 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sdc2P43407 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sdc2P43407 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sdc2P43407 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sdc2P43407 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sdc2P43407 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sdc2P43407 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sdc2P43407 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sdc2P43407 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sdc2P43407 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sdc2P43407 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sdc2P43407 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sdc2P43407 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sdc2P43407 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sdc2P43407 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sdc2P43407 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sdc2P43407 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sdc2P43407 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sdc2P43407 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sdc2P43407 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sdc2P43407 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sdc2P43407 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sdc2P43407 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sdc2P43407 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sdc2P43407 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sdc2P43407 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sdc2P43407 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Sdc2P43407 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sdc2P43407 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sdc2P43407 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Sdc2P43407 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sdc2P43407 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sdc2P43407 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sdc2P43407 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sdc2P43407 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sdc2P43407 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sdc2P43407 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sdc2P43407 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sdc2P43407 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sdc2P43407 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sdc2P43407 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sdc2P43407 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sdc2P43407 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sdc2P43407 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sdc2P43407 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sdc2P43407 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sdc2P43407 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sdc2P43407 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sdc2P43407 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sdc2P43407 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sdc2P43407 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sdc2P43407 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sdc2P43407 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sdc2P43407 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sdc2P43407 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sdc2P43407 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sdc2P43407 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Sdc2P43407 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sdc2P43407 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Sdc2P43407 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Sdc2P43407 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Sdc2P43407 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Sdc2P43407 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Sdc2P43407 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Sdc2P43407 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Sdc2P43407 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Sdc2P43407 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Sdc2P43407 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sdc2P43407 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sdc2P43407 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sdc2P43407 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sdc2P43407 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sdc2P43407 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sdc2P43407 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sdc2P43407 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sdc2P43407 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sdc2P43407 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sdc2P43407 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sdc2P43407 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sdc2P43407 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sdc2P43407 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sdc2P43407 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sdc2P43407 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sdc2P43407 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sdc2P43407 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms