Protein–RNA interactions for Protein: P41155

Ltb, Lymphotoxin-beta, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbP41155 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LtbP41155 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LtbP41155 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LtbP41155 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
LtbP41155 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LtbP41155 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LtbP41155 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LtbP41155 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LtbP41155 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LtbP41155 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LtbP41155 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LtbP41155 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LtbP41155 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LtbP41155 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LtbP41155 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LtbP41155 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LtbP41155 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LtbP41155 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LtbP41155 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LtbP41155 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LtbP41155 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
LtbP41155 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LtbP41155 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LtbP41155 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LtbP41155 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LtbP41155 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LtbP41155 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LtbP41155 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LtbP41155 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
LtbP41155 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LtbP41155 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LtbP41155 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
LtbP41155 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LtbP41155 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LtbP41155 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LtbP41155 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LtbP41155 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LtbP41155 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LtbP41155 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LtbP41155 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LtbP41155 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LtbP41155 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LtbP41155 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
LtbP41155 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LtbP41155 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LtbP41155 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LtbP41155 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LtbP41155 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
LtbP41155 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LtbP41155 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LtbP41155 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LtbP41155 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LtbP41155 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LtbP41155 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LtbP41155 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LtbP41155 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LtbP41155 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LtbP41155 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LtbP41155 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LtbP41155 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LtbP41155 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LtbP41155 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LtbP41155 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LtbP41155 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LtbP41155 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LtbP41155 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LtbP41155 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LtbP41155 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LtbP41155 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LtbP41155 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LtbP41155 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LtbP41155 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
LtbP41155 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LtbP41155 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LtbP41155 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LtbP41155 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LtbP41155 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
LtbP41155 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
LtbP41155 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LtbP41155 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LtbP41155 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LtbP41155 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LtbP41155 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LtbP41155 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
LtbP41155 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LtbP41155 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LtbP41155 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LtbP41155 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LtbP41155 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LtbP41155 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LtbP41155 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LtbP41155 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LtbP41155 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LtbP41155 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LtbP41155 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LtbP41155 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LtbP41155 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LtbP41155 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LtbP41155 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LtbP41155 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms