Protein–RNA interactions for Protein: P40240

Cd9, CD9 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd9P40240 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cd9P40240 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cd9P40240 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cd9P40240 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cd9P40240 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cd9P40240 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cd9P40240 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cd9P40240 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cd9P40240 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cd9P40240 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cd9P40240 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cd9P40240 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cd9P40240 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cd9P40240 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cd9P40240 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cd9P40240 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cd9P40240 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cd9P40240 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cd9P40240 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cd9P40240 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cd9P40240 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cd9P40240 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cd9P40240 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cd9P40240 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cd9P40240 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cd9P40240 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Cd9P40240 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cd9P40240 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Cd9P40240 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cd9P40240 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cd9P40240 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cd9P40240 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cd9P40240 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cd9P40240 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cd9P40240 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cd9P40240 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cd9P40240 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cd9P40240 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cd9P40240 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cd9P40240 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cd9P40240 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cd9P40240 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cd9P40240 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cd9P40240 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cd9P40240 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cd9P40240 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cd9P40240 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cd9P40240 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Cd9P40240 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cd9P40240 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cd9P40240 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cd9P40240 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cd9P40240 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cd9P40240 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cd9P40240 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Cd9P40240 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cd9P40240 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cd9P40240 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Cd9P40240 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Cd9P40240 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cd9P40240 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cd9P40240 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Cd9P40240 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Cd9P40240 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cd9P40240 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cd9P40240 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Cd9P40240 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cd9P40240 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cd9P40240 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cd9P40240 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cd9P40240 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cd9P40240 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cd9P40240 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cd9P40240 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Cd9P40240 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cd9P40240 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cd9P40240 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cd9P40240 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cd9P40240 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cd9P40240 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cd9P40240 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cd9P40240 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cd9P40240 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cd9P40240 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cd9P40240 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cd9P40240 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cd9P40240 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cd9P40240 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cd9P40240 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cd9P40240 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cd9P40240 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cd9P40240 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cd9P40240 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cd9P40240 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Cd9P40240 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cd9P40240 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cd9P40240 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cd9P40240 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cd9P40240 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cd9P40240 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 199.1 ms