Protein–RNA interactions for Protein: P35601

Rfc1, Replication factor C subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfc1P35601 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rfc1P35601 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rfc1P35601 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rfc1P35601 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rfc1P35601 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rfc1P35601 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rfc1P35601 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rfc1P35601 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rfc1P35601 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rfc1P35601 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Rfc1P35601 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Rfc1P35601 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rfc1P35601 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rfc1P35601 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rfc1P35601 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Rfc1P35601 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rfc1P35601 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rfc1P35601 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rfc1P35601 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rfc1P35601 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rfc1P35601 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rfc1P35601 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rfc1P35601 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rfc1P35601 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rfc1P35601 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rfc1P35601 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Rfc1P35601 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rfc1P35601 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rfc1P35601 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rfc1P35601 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rfc1P35601 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Rfc1P35601 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rfc1P35601 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rfc1P35601 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rfc1P35601 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rfc1P35601 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rfc1P35601 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rfc1P35601 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rfc1P35601 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rfc1P35601 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rfc1P35601 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rfc1P35601 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Rfc1P35601 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rfc1P35601 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rfc1P35601 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rfc1P35601 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rfc1P35601 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rfc1P35601 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rfc1P35601 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rfc1P35601 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rfc1P35601 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rfc1P35601 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rfc1P35601 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rfc1P35601 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rfc1P35601 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rfc1P35601 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rfc1P35601 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rfc1P35601 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rfc1P35601 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Rfc1P35601 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rfc1P35601 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rfc1P35601 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rfc1P35601 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rfc1P35601 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rfc1P35601 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rfc1P35601 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rfc1P35601 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rfc1P35601 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Rfc1P35601 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rfc1P35601 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rfc1P35601 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rfc1P35601 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rfc1P35601 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rfc1P35601 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rfc1P35601 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rfc1P35601 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rfc1P35601 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rfc1P35601 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rfc1P35601 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rfc1P35601 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rfc1P35601 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Rfc1P35601 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rfc1P35601 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rfc1P35601 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Rfc1P35601 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rfc1P35601 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rfc1P35601 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rfc1P35601 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rfc1P35601 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rfc1P35601 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rfc1P35601 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rfc1P35601 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rfc1P35601 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rfc1P35601 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rfc1P35601 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rfc1P35601 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rfc1P35601 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rfc1P35601 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rfc1P35601 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rfc1P35601 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms