Protein–RNA interactions for Protein: P33622

Apoc3, Apolipoprotein C-III, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc3P33622 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Apoc3P33622 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Apoc3P33622 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Apoc3P33622 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Apoc3P33622 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Apoc3P33622 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Apoc3P33622 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Apoc3P33622 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Apoc3P33622 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Apoc3P33622 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Apoc3P33622 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Apoc3P33622 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Apoc3P33622 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Apoc3P33622 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Apoc3P33622 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Apoc3P33622 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Apoc3P33622 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Apoc3P33622 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Apoc3P33622 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Apoc3P33622 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Apoc3P33622 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Apoc3P33622 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Apoc3P33622 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Apoc3P33622 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Apoc3P33622 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Apoc3P33622 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Apoc3P33622 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Apoc3P33622 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Apoc3P33622 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Apoc3P33622 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Apoc3P33622 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Apoc3P33622 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Apoc3P33622 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Apoc3P33622 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Apoc3P33622 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Apoc3P33622 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Apoc3P33622 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Apoc3P33622 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Apoc3P33622 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Apoc3P33622 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Apoc3P33622 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Apoc3P33622 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Apoc3P33622 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Apoc3P33622 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Apoc3P33622 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Apoc3P33622 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Apoc3P33622 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Apoc3P33622 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Apoc3P33622 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Apoc3P33622 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Apoc3P33622 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Apoc3P33622 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Apoc3P33622 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Apoc3P33622 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Apoc3P33622 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Apoc3P33622 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Apoc3P33622 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Apoc3P33622 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Apoc3P33622 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Apoc3P33622 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Apoc3P33622 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Apoc3P33622 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Apoc3P33622 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Apoc3P33622 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Apoc3P33622 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Apoc3P33622 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Apoc3P33622 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Apoc3P33622 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Apoc3P33622 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Apoc3P33622 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Apoc3P33622 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Apoc3P33622 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Apoc3P33622 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Apoc3P33622 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Apoc3P33622 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Apoc3P33622 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Apoc3P33622 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Apoc3P33622 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Apoc3P33622 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Apoc3P33622 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Apoc3P33622 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Apoc3P33622 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Apoc3P33622 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Apoc3P33622 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Apoc3P33622 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Apoc3P33622 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Apoc3P33622 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Apoc3P33622 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Apoc3P33622 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Apoc3P33622 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Apoc3P33622 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Apoc3P33622 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Apoc3P33622 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Apoc3P33622 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Apoc3P33622 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Apoc3P33622 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Apoc3P33622 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Apoc3P33622 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Apoc3P33622 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Apoc3P33622 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms