Protein–RNA interactions for Protein: P32958

Rom1, Rod outer segment membrane protein 1, mousemouse

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Length 351 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rom1P32958 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rom1P32958 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rom1P32958 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rom1P32958 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rom1P32958 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rom1P32958 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rom1P32958 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rom1P32958 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Rom1P32958 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rom1P32958 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rom1P32958 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rom1P32958 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rom1P32958 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rom1P32958 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rom1P32958 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rom1P32958 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rom1P32958 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rom1P32958 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rom1P32958 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rom1P32958 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rom1P32958 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rom1P32958 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rom1P32958 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rom1P32958 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rom1P32958 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rom1P32958 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rom1P32958 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rom1P32958 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Rom1P32958 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rom1P32958 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rom1P32958 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rom1P32958 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rom1P32958 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Rom1P32958 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rom1P32958 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rom1P32958 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rom1P32958 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rom1P32958 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rom1P32958 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rom1P32958 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rom1P32958 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rom1P32958 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rom1P32958 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rom1P32958 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rom1P32958 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Rom1P32958 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rom1P32958 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rom1P32958 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rom1P32958 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rom1P32958 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rom1P32958 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rom1P32958 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rom1P32958 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rom1P32958 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Rom1P32958 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rom1P32958 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rom1P32958 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rom1P32958 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rom1P32958 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rom1P32958 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rom1P32958 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rom1P32958 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rom1P32958 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rom1P32958 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Rom1P32958 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rom1P32958 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rom1P32958 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rom1P32958 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rom1P32958 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rom1P32958 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rom1P32958 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rom1P32958 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rom1P32958 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rom1P32958 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rom1P32958 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rom1P32958 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rom1P32958 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rom1P32958 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rom1P32958 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rom1P32958 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rom1P32958 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rom1P32958 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rom1P32958 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rom1P32958 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rom1P32958 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rom1P32958 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Rom1P32958 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rom1P32958 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rom1P32958 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rom1P32958 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rom1P32958 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rom1P32958 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rom1P32958 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rom1P32958 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Rom1P32958 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Rom1P32958 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Rom1P32958 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rom1P32958 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rom1P32958 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rom1P32958 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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