Protein–RNA interactions for Protein: P30285

Cdk4, Cyclin-dependent kinase 4, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk4P30285 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cdk4P30285 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cdk4P30285 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cdk4P30285 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cdk4P30285 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cdk4P30285 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Cdk4P30285 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Cdk4P30285 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cdk4P30285 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cdk4P30285 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cdk4P30285 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cdk4P30285 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdk4P30285 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdk4P30285 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdk4P30285 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdk4P30285 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdk4P30285 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdk4P30285 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cdk4P30285 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cdk4P30285 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Cdk4P30285 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Cdk4P30285 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cdk4P30285 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cdk4P30285 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Cdk4P30285 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Cdk4P30285 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cdk4P30285 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cdk4P30285 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Cdk4P30285 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cdk4P30285 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdk4P30285 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdk4P30285 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdk4P30285 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdk4P30285 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdk4P30285 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdk4P30285 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdk4P30285 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdk4P30285 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdk4P30285 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdk4P30285 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdk4P30285 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cdk4P30285 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cdk4P30285 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cdk4P30285 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cdk4P30285 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdk4P30285 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdk4P30285 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdk4P30285 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdk4P30285 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdk4P30285 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdk4P30285 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdk4P30285 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdk4P30285 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdk4P30285 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdk4P30285 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdk4P30285 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdk4P30285 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdk4P30285 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdk4P30285 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdk4P30285 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cdk4P30285 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cdk4P30285 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cdk4P30285 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cdk4P30285 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cdk4P30285 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cdk4P30285 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cdk4P30285 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cdk4P30285 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cdk4P30285 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdk4P30285 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdk4P30285 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdk4P30285 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdk4P30285 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdk4P30285 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdk4P30285 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cdk4P30285 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cdk4P30285 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cdk4P30285 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cdk4P30285 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cdk4P30285 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cdk4P30285 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cdk4P30285 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Cdk4P30285 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cdk4P30285 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cdk4P30285 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cdk4P30285 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cdk4P30285 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cdk4P30285 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cdk4P30285 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cdk4P30285 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cdk4P30285 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cdk4P30285 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cdk4P30285 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Cdk4P30285 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cdk4P30285 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cdk4P30285 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cdk4P30285 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cdk4P30285 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cdk4P30285 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdk4P30285 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms