Protein–RNA interactions for Protein: P29416

Hexa, Beta-hexosaminidase subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HexaP29416 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HexaP29416 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HexaP29416 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HexaP29416 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HexaP29416 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HexaP29416 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HexaP29416 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HexaP29416 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HexaP29416 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HexaP29416 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HexaP29416 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HexaP29416 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HexaP29416 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HexaP29416 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HexaP29416 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
HexaP29416 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HexaP29416 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HexaP29416 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HexaP29416 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HexaP29416 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HexaP29416 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HexaP29416 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HexaP29416 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HexaP29416 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HexaP29416 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
HexaP29416 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HexaP29416 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HexaP29416 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
HexaP29416 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HexaP29416 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HexaP29416 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HexaP29416 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HexaP29416 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HexaP29416 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HexaP29416 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HexaP29416 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HexaP29416 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HexaP29416 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HexaP29416 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
HexaP29416 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HexaP29416 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HexaP29416 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HexaP29416 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HexaP29416 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HexaP29416 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HexaP29416 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HexaP29416 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HexaP29416 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HexaP29416 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HexaP29416 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HexaP29416 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HexaP29416 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HexaP29416 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HexaP29416 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HexaP29416 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HexaP29416 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HexaP29416 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HexaP29416 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HexaP29416 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HexaP29416 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HexaP29416 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HexaP29416 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HexaP29416 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HexaP29416 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HexaP29416 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
HexaP29416 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HexaP29416 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HexaP29416 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HexaP29416 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HexaP29416 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HexaP29416 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HexaP29416 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HexaP29416 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HexaP29416 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HexaP29416 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HexaP29416 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HexaP29416 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HexaP29416 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HexaP29416 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
HexaP29416 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HexaP29416 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HexaP29416 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HexaP29416 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HexaP29416 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HexaP29416 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HexaP29416 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HexaP29416 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HexaP29416 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HexaP29416 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HexaP29416 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HexaP29416 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HexaP29416 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HexaP29416 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HexaP29416 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HexaP29416 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HexaP29416 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HexaP29416 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HexaP29416 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HexaP29416 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HexaP29416 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms