Protein–RNA interactions for Protein: P28741

Kif3a, Kinesin-like protein KIF3A, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif3aP28741 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Kif3aP28741 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Kif3aP28741 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Kif3aP28741 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Kif3aP28741 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Kif3aP28741 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Kif3aP28741 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Kif3aP28741 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Kif3aP28741 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Kif3aP28741 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Kif3aP28741 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Kif3aP28741 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Kif3aP28741 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Kif3aP28741 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Kif3aP28741 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Kif3aP28741 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Kif3aP28741 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Kif3aP28741 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Kif3aP28741 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Kif3aP28741 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Kif3aP28741 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Kif3aP28741 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Kif3aP28741 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Kif3aP28741 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Kif3aP28741 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Kif3aP28741 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Kif3aP28741 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Kif3aP28741 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Kif3aP28741 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Kif3aP28741 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Kif3aP28741 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Kif3aP28741 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Kif3aP28741 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Kif3aP28741 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Kif3aP28741 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Kif3aP28741 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Kif3aP28741 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Kif3aP28741 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Kif3aP28741 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Kif3aP28741 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Kif3aP28741 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Kif3aP28741 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Kif3aP28741 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Kif3aP28741 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Kif3aP28741 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Kif3aP28741 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Kif3aP28741 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Kif3aP28741 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Kif3aP28741 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Kif3aP28741 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Kif3aP28741 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Kif3aP28741 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Kif3aP28741 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Kif3aP28741 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Kif3aP28741 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Kif3aP28741 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Kif3aP28741 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Kif3aP28741 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Kif3aP28741 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Kif3aP28741 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Kif3aP28741 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Kif3aP28741 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Kif3aP28741 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Kif3aP28741 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Kif3aP28741 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Kif3aP28741 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Kif3aP28741 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Kif3aP28741 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Kif3aP28741 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Kif3aP28741 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Kif3aP28741 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Kif3aP28741 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Kif3aP28741 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Kif3aP28741 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Kif3aP28741 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Kif3aP28741 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Kif3aP28741 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Kif3aP28741 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Kif3aP28741 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Kif3aP28741 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Kif3aP28741 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Kif3aP28741 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Kif3aP28741 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Kif3aP28741 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Kif3aP28741 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Kif3aP28741 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Kif3aP28741 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Kif3aP28741 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Kif3aP28741 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Kif3aP28741 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Kif3aP28741 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Kif3aP28741 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Kif3aP28741 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Kif3aP28741 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Kif3aP28741 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Kif3aP28741 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Kif3aP28741 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Kif3aP28741 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Kif3aP28741 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Kif3aP28741 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms