Protein–RNA interactions for Protein: P28236

Gja8, Gap junction alpha-8 protein, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja8P28236 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gja8P28236 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Gja8P28236 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gja8P28236 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gja8P28236 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gja8P28236 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Gja8P28236 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Gja8P28236 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gja8P28236 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gja8P28236 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gja8P28236 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gja8P28236 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gja8P28236 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gja8P28236 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Gja8P28236 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Gja8P28236 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gja8P28236 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gja8P28236 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gja8P28236 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gja8P28236 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gja8P28236 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gja8P28236 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gja8P28236 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gja8P28236 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gja8P28236 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gja8P28236 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gja8P28236 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Gja8P28236 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gja8P28236 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gja8P28236 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gja8P28236 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gja8P28236 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gja8P28236 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Gja8P28236 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gja8P28236 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gja8P28236 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gja8P28236 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gja8P28236 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gja8P28236 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gja8P28236 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gja8P28236 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Gja8P28236 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gja8P28236 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Gja8P28236 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gja8P28236 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gja8P28236 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gja8P28236 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gja8P28236 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gja8P28236 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gja8P28236 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gja8P28236 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gja8P28236 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gja8P28236 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gja8P28236 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gja8P28236 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Gja8P28236 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gja8P28236 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gja8P28236 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gja8P28236 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gja8P28236 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Gja8P28236 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gja8P28236 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gja8P28236 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gja8P28236 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gja8P28236 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gja8P28236 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gja8P28236 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gja8P28236 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gja8P28236 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gja8P28236 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Gja8P28236 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gja8P28236 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gja8P28236 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gja8P28236 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gja8P28236 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gja8P28236 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Gja8P28236 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Gja8P28236 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gja8P28236 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gja8P28236 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gja8P28236 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gja8P28236 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gja8P28236 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gja8P28236 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gja8P28236 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gja8P28236 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gja8P28236 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gja8P28236 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gja8P28236 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gja8P28236 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gja8P28236 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gja8P28236 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gja8P28236 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gja8P28236 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gja8P28236 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gja8P28236 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gja8P28236 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gja8P28236 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gja8P28236 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gja8P28236 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms