Protein–RNA interactions for Protein: P28063

Psmb8, Proteasome subunit beta type-8, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb8P28063 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psmb8P28063 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psmb8P28063 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psmb8P28063 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psmb8P28063 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psmb8P28063 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psmb8P28063 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psmb8P28063 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psmb8P28063 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psmb8P28063 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psmb8P28063 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psmb8P28063 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Psmb8P28063 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psmb8P28063 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psmb8P28063 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psmb8P28063 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psmb8P28063 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psmb8P28063 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psmb8P28063 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psmb8P28063 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psmb8P28063 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psmb8P28063 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psmb8P28063 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psmb8P28063 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Psmb8P28063 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psmb8P28063 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psmb8P28063 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psmb8P28063 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psmb8P28063 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psmb8P28063 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psmb8P28063 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psmb8P28063 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psmb8P28063 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psmb8P28063 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psmb8P28063 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psmb8P28063 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psmb8P28063 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Psmb8P28063 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Psmb8P28063 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Psmb8P28063 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Psmb8P28063 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Psmb8P28063 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Psmb8P28063 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psmb8P28063 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psmb8P28063 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psmb8P28063 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psmb8P28063 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psmb8P28063 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psmb8P28063 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psmb8P28063 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psmb8P28063 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psmb8P28063 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psmb8P28063 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psmb8P28063 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psmb8P28063 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psmb8P28063 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psmb8P28063 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psmb8P28063 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psmb8P28063 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psmb8P28063 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psmb8P28063 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psmb8P28063 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psmb8P28063 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Psmb8P28063 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Psmb8P28063 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Psmb8P28063 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Psmb8P28063 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Psmb8P28063 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Psmb8P28063 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psmb8P28063 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psmb8P28063 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psmb8P28063 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psmb8P28063 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psmb8P28063 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psmb8P28063 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psmb8P28063 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psmb8P28063 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psmb8P28063 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psmb8P28063 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psmb8P28063 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psmb8P28063 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psmb8P28063 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psmb8P28063 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psmb8P28063 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Psmb8P28063 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psmb8P28063 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Psmb8P28063 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Psmb8P28063 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Psmb8P28063 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Psmb8P28063 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Psmb8P28063 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Psmb8P28063 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Psmb8P28063 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Psmb8P28063 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Psmb8P28063 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Psmb8P28063 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Psmb8P28063 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Psmb8P28063 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psmb8P28063 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psmb8P28063 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms