Protein–RNA interactions for Protein: P27664

Pde6a, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6aP27664 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pde6aP27664 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pde6aP27664 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pde6aP27664 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pde6aP27664 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pde6aP27664 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pde6aP27664 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pde6aP27664 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pde6aP27664 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pde6aP27664 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pde6aP27664 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pde6aP27664 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pde6aP27664 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Pde6aP27664 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pde6aP27664 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pde6aP27664 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pde6aP27664 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pde6aP27664 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pde6aP27664 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pde6aP27664 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Pde6aP27664 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pde6aP27664 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Pde6aP27664 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pde6aP27664 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pde6aP27664 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pde6aP27664 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pde6aP27664 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pde6aP27664 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pde6aP27664 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pde6aP27664 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pde6aP27664 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pde6aP27664 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pde6aP27664 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pde6aP27664 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pde6aP27664 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pde6aP27664 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pde6aP27664 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pde6aP27664 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pde6aP27664 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pde6aP27664 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pde6aP27664 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pde6aP27664 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pde6aP27664 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pde6aP27664 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pde6aP27664 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pde6aP27664 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pde6aP27664 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pde6aP27664 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pde6aP27664 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pde6aP27664 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pde6aP27664 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pde6aP27664 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pde6aP27664 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pde6aP27664 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pde6aP27664 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pde6aP27664 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pde6aP27664 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pde6aP27664 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pde6aP27664 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pde6aP27664 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pde6aP27664 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pde6aP27664 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pde6aP27664 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pde6aP27664 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pde6aP27664 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pde6aP27664 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pde6aP27664 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pde6aP27664 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pde6aP27664 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pde6aP27664 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pde6aP27664 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pde6aP27664 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pde6aP27664 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pde6aP27664 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Pde6aP27664 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Pde6aP27664 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pde6aP27664 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pde6aP27664 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pde6aP27664 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pde6aP27664 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pde6aP27664 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pde6aP27664 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pde6aP27664 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pde6aP27664 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pde6aP27664 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pde6aP27664 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pde6aP27664 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pde6aP27664 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pde6aP27664 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pde6aP27664 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Pde6aP27664 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Pde6aP27664 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pde6aP27664 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pde6aP27664 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pde6aP27664 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pde6aP27664 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pde6aP27664 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pde6aP27664 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pde6aP27664 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Pde6aP27664 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms