Protein–RNA interactions for Protein: P26339

Chga, Chromogranin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChgaP26339 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ChgaP26339 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ChgaP26339 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ChgaP26339 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ChgaP26339 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ChgaP26339 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ChgaP26339 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ChgaP26339 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ChgaP26339 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ChgaP26339 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ChgaP26339 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ChgaP26339 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ChgaP26339 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ChgaP26339 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ChgaP26339 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ChgaP26339 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
ChgaP26339 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ChgaP26339 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ChgaP26339 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ChgaP26339 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ChgaP26339 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ChgaP26339 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ChgaP26339 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ChgaP26339 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ChgaP26339 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ChgaP26339 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ChgaP26339 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ChgaP26339 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ChgaP26339 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ChgaP26339 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ChgaP26339 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ChgaP26339 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ChgaP26339 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ChgaP26339 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ChgaP26339 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ChgaP26339 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ChgaP26339 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ChgaP26339 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ChgaP26339 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
ChgaP26339 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
ChgaP26339 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
ChgaP26339 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ChgaP26339 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ChgaP26339 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ChgaP26339 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ChgaP26339 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ChgaP26339 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ChgaP26339 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ChgaP26339 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ChgaP26339 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ChgaP26339 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ChgaP26339 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ChgaP26339 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ChgaP26339 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ChgaP26339 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ChgaP26339 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ChgaP26339 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ChgaP26339 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ChgaP26339 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ChgaP26339 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ChgaP26339 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ChgaP26339 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ChgaP26339 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ChgaP26339 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ChgaP26339 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ChgaP26339 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ChgaP26339 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ChgaP26339 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ChgaP26339 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ChgaP26339 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ChgaP26339 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ChgaP26339 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ChgaP26339 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ChgaP26339 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ChgaP26339 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ChgaP26339 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ChgaP26339 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ChgaP26339 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
ChgaP26339 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ChgaP26339 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ChgaP26339 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
ChgaP26339 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ChgaP26339 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ChgaP26339 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ChgaP26339 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ChgaP26339 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ChgaP26339 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ChgaP26339 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ChgaP26339 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ChgaP26339 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ChgaP26339 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ChgaP26339 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ChgaP26339 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ChgaP26339 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ChgaP26339 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ChgaP26339 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ChgaP26339 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ChgaP26339 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ChgaP26339 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ChgaP26339 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms