Protein–RNA interactions for Protein: P23772

Gata3, Trans-acting T-cell-specific transcription factor GATA-3, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata3P23772 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gata3P23772 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gata3P23772 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gata3P23772 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gata3P23772 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gata3P23772 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gata3P23772 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gata3P23772 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gata3P23772 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gata3P23772 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gata3P23772 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gata3P23772 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gata3P23772 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gata3P23772 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gata3P23772 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gata3P23772 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gata3P23772 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gata3P23772 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gata3P23772 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gata3P23772 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gata3P23772 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gata3P23772 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gata3P23772 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gata3P23772 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gata3P23772 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gata3P23772 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gata3P23772 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gata3P23772 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gata3P23772 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gata3P23772 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gata3P23772 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gata3P23772 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gata3P23772 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gata3P23772 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gata3P23772 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gata3P23772 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gata3P23772 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gata3P23772 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gata3P23772 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gata3P23772 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gata3P23772 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gata3P23772 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gata3P23772 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gata3P23772 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gata3P23772 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gata3P23772 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gata3P23772 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gata3P23772 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gata3P23772 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gata3P23772 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gata3P23772 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gata3P23772 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gata3P23772 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gata3P23772 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gata3P23772 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gata3P23772 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gata3P23772 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gata3P23772 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gata3P23772 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gata3P23772 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gata3P23772 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gata3P23772 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gata3P23772 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gata3P23772 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gata3P23772 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gata3P23772 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gata3P23772 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gata3P23772 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gata3P23772 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gata3P23772 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gata3P23772 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gata3P23772 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gata3P23772 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gata3P23772 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gata3P23772 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gata3P23772 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gata3P23772 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gata3P23772 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gata3P23772 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gata3P23772 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gata3P23772 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gata3P23772 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gata3P23772 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gata3P23772 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gata3P23772 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gata3P23772 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gata3P23772 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gata3P23772 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gata3P23772 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gata3P23772 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gata3P23772 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gata3P23772 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gata3P23772 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gata3P23772 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gata3P23772 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gata3P23772 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gata3P23772 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gata3P23772 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gata3P23772 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gata3P23772 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms