Protein–RNA interactions for Protein: P23611

Irf8, Interferon regulatory factor 8, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf8P23611 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Irf8P23611 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Irf8P23611 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Irf8P23611 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Irf8P23611 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Irf8P23611 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Irf8P23611 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Irf8P23611 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Irf8P23611 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Irf8P23611 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Irf8P23611 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Irf8P23611 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Irf8P23611 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Irf8P23611 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Irf8P23611 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Irf8P23611 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Irf8P23611 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Irf8P23611 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Irf8P23611 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Irf8P23611 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Irf8P23611 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Irf8P23611 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Irf8P23611 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Irf8P23611 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Irf8P23611 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Irf8P23611 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Irf8P23611 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Irf8P23611 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Irf8P23611 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Irf8P23611 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Irf8P23611 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Irf8P23611 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Irf8P23611 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Irf8P23611 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Irf8P23611 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Irf8P23611 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Irf8P23611 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Irf8P23611 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Irf8P23611 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Irf8P23611 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Irf8P23611 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Irf8P23611 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Irf8P23611 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Irf8P23611 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Irf8P23611 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Irf8P23611 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Irf8P23611 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Irf8P23611 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Irf8P23611 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Irf8P23611 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Irf8P23611 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Irf8P23611 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Irf8P23611 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Irf8P23611 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Irf8P23611 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Irf8P23611 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Irf8P23611 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Irf8P23611 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Irf8P23611 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Irf8P23611 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Irf8P23611 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Irf8P23611 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Irf8P23611 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Irf8P23611 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Irf8P23611 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Irf8P23611 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Irf8P23611 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Irf8P23611 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Irf8P23611 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Irf8P23611 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Irf8P23611 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Irf8P23611 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Irf8P23611 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Irf8P23611 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Irf8P23611 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Irf8P23611 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Irf8P23611 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Irf8P23611 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Irf8P23611 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Irf8P23611 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Irf8P23611 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Irf8P23611 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Irf8P23611 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Irf8P23611 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Irf8P23611 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Irf8P23611 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Irf8P23611 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Irf8P23611 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Irf8P23611 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Irf8P23611 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Irf8P23611 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Irf8P23611 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Irf8P23611 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Irf8P23611 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Irf8P23611 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Irf8P23611 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Irf8P23611 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Irf8P23611 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Irf8P23611 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Irf8P23611 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.3 ms