Protein–RNA interactions for Protein: P19137

Lama1, Laminin subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 3,084 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lama1P19137 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Lama1P19137 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Lama1P19137 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Lama1P19137 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Lama1P19137 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Lama1P19137 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Lama1P19137 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Lama1P19137 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Lama1P19137 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Lama1P19137 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lama1P19137 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lama1P19137 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lama1P19137 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lama1P19137 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lama1P19137 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lama1P19137 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Lama1P19137 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lama1P19137 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Lama1P19137 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lama1P19137 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lama1P19137 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lama1P19137 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lama1P19137 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lama1P19137 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lama1P19137 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lama1P19137 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lama1P19137 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lama1P19137 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lama1P19137 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lama1P19137 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lama1P19137 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lama1P19137 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lama1P19137 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lama1P19137 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lama1P19137 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Lama1P19137 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lama1P19137 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Lama1P19137 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lama1P19137 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Lama1P19137 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Lama1P19137 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lama1P19137 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lama1P19137 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lama1P19137 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Lama1P19137 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Lama1P19137 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Lama1P19137 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lama1P19137 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Lama1P19137 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lama1P19137 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lama1P19137 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lama1P19137 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Lama1P19137 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lama1P19137 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lama1P19137 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lama1P19137 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lama1P19137 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lama1P19137 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lama1P19137 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lama1P19137 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lama1P19137 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lama1P19137 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lama1P19137 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lama1P19137 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lama1P19137 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lama1P19137 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lama1P19137 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lama1P19137 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lama1P19137 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lama1P19137 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lama1P19137 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lama1P19137 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lama1P19137 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lama1P19137 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lama1P19137 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lama1P19137 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lama1P19137 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lama1P19137 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lama1P19137 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lama1P19137 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lama1P19137 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lama1P19137 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lama1P19137 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lama1P19137 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lama1P19137 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Lama1P19137 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lama1P19137 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lama1P19137 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lama1P19137 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lama1P19137 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lama1P19137 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lama1P19137 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lama1P19137 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lama1P19137 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lama1P19137 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lama1P19137 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lama1P19137 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lama1P19137 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lama1P19137 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lama1P19137 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1343.6 ms